In LS 2025/22026: Lectures will be held regularly on Thursdays at 10:45 a.m., starting on February 19. Only in the event of a business trip or illness of the lecturer will they be held online on the GoogleMeet platform.
Examination conditions – written exam. After achieving the minimum number of points, an oral exam will be held.
Presentations will be available on the course coordinator's Google Drive.
More information will be provided during the first lecture.
The lecture will focus primarily on viruses that cause common diseases in humans and animals and are routinely diagnosed in practice. The main emphasis will be on diagnostic principles and epidemiological aspects.
The introduction will define some basic concepts of pathogenesis, epidemiology, and molecular epidemiology, the principles of evaluating diagnostic methods and commercial tests, the methods and principles of work in a virology laboratory, the principles of good laboratory practice, and primary prevention - vaccination.
Further lectures will focus on groups of viruses that cause diseases with similar clinical manifestations, e.g., respiratory viruses, viruses that cause hepatitis, etc. For each group, the mode of transmission, incubation period, types of infection, clinical manifestations, diagnosis, prevention, and prophylaxis will be discussed.
Lectures focused on animal viruses will be divided into viruses causing zoonoses or having zoonotic potential, viruses of exceptional economic importance, and finally, viruses with remarkable or as yet unexplained pathogenesis of disease.
Completion of a basic virology course is expected.
Last update: Tachezy Ruth, prof. RNDr., Ph.D. (13.01.2026)
V LS 2025/22026: Přednášky budou, pravidelně ve čtvrtek od 10:45 hodin, začátek 19.2., pouze v případě služební cesty či nemoci přednášejícího budou probíhat online na platformě GoogleMeet.
Podmínky zkoušení – písemná zkouška. Po dosažení minimálního počtu bodů zkouška ústní.
Prezentace budou k dispozici na Google disku garantky předmětu.
Více informací dostanete na 1. přednášce.
Přednáška bude zaměřena především na viry, které vyvolávají častá onemocnění u lidí a zvířat a jejichž diagnostika se provádí v rutinní praxi. Hlavní důraz bude na diagnostické principy a epidemiologické aspekty.
V úvodu budou vymezeny některé základní pojmy patogeneze, epidemiologie a molekulární epidemiologie, principy hodnocení diagnostických metod a komerčních testů, způsob a principy práce ve virologické laboratoři, zásady správné laboratorní praxe, primární prevence - očkování.
Další přednášky budou zaměřené na skupiny virů vyvolávajících onemocnění s podobnou klinickou manifestací např. respirační viry, viry vyvolávající hepatitidy apod. Pro každou skupinu bude probrán způsob přenosu, inkubační doba, typy infekce, klinické projevy, diagnostika, prevence a profylaxe.
Přednášky zaměřené na zvířecí viry budou rozděleny na viry vyvolávající zoonózy nebo mající zoonotický potenciál, dále na viry s mimořádným ekonomickým významem a konečně na viry s pozoruhodnou nebo dosud neobjasněnou patogenezí onemocnění.
Předpokládá se absolvování základní přednášky virologie.
Last update: Tachezy Ruth, prof. RNDr., Ph.D. (13.01.2026)
Literature
Literature:
The molecular epidemiology of human viruses: ed. Thomas Leitner, 2002 Veterinary Virology: Frederick A. Murphy, E. Paul J. Gibbs, Marian C. Horzinek, Michael J. Studdert, Third Edition, Epidemiologic methods in studying chronic diseases: Jedrychowski W. a Maugeri U., 2000 Cancer epidemiology: principles and methods: IARC 1999 Encyclopedia of Virology: Granoff and Webster ed., 2nd edition, 1999 Medical Virology: White and Fenner, 4th edition, 1994 Medical Microbiology: Murray, Rosenthal, Kobayashi, Pfaller, 4th edition, 2002 Fields Virology: Fields, Knipe and Howley, 3rd edition, 1996 Viruses and Human Disease: Strauss and Strauss, 2nd edition, 2007
Last update: Tachezy Ruth, prof. RNDr., Ph.D. (25.10.2019)
Requirements to the exam
Students must past written and oral part of the exam.
Written exam:
Maximum 5 points per question. Altogether 210 points.
To be able to continue to oral exam the minimum of > 105 points (50%) has to be reached, but the best mark will be than 3 without the possibility to improve it during the oral examination.
126 – 147 bodů 3
148 – 168 bodů 2
169 – 210 bodu 1
105 50%
126 60%
147 70%
168 80%
189 90%
Last update: Tachezy Ruth, prof. RNDr., Ph.D. (25.10.2019)
Syllabus -
Pathogenesis of viral diseases. Basic concepts of epidemiology and molecular epidemiology. Types of studies, concepts of prevalence, incidence, mortality, morbidity, principles of using molecular epidemiology in virology, proving the etiological link between viral infection and disease, disease eradication, epidemics, and pandemics. Laboratory methods. Overview of diagnostic methods used in routine practice and their principles, collection of clinical samples, transport, pre-analytical phase of clinical material processing, good laboratory practice (e.g., external quality assessment, laboratory accreditation, recommendations), sensitivity, specificity, PPV, NPV, RLU curve, analytical sensitivity, clinical sensitivity of diagnostic tests, in vitro diagnostics, and reliability of commercial kits.
HBV, HAV, HCV, and other viruses which cause hepatitis Herpes viruses - HSV1,2, CMV, EBV, HHV6, HHV8, VZV Influenza and other respiratory viruses HIV, HPV Viral gastroenteritis - rotaviruses, noroviruses, astroviruses Rubella, mumps, measles Viral infections of the CNS - tick-borne encephalitis, JCV Newly emerging and recurrent infections - Zika, Dengue, Yellow fever virus Zoonoses – rabies virus, mammalian and avian influenza viruses, paramyxoviruses Economically significant viral infections in animals – pestiviruses, foot-and-mouth disease virus, Newcastle disease virus Infections in dogs and cats (herpesviruses, caliciviruses)
Last update: Tachezy Ruth, prof. RNDr., Ph.D. (13.01.2026)
Patogeneze virových onemocnění. Základní pojmy epidemiologie a molekulární epidemiologie. Typy studií, pojem prevalence, incidence, mortalita, morbidita, principy využití molekulární epidemiologie ve virologii, průkaz etiologické souvislosti virové infekce s onemocněním, eradikace onemocnění, epidemie, pandemie. Laboratorní metody. Přehled diagnostických metod používaných pro rutinní praxi a jejich principy, odběr klinických vzorků, transport, preanalytická fáze zpracování klinických materiálů, správná laboratorní praxe (např. externí hodnocení kvality, akreditace laboratoří, doporučení), citlivost, specificita, PPV, NPV, RLU křivka, analytická citlivost, klinická citlivost diagnostických testů, in vitro diagnostika a spolehlivost komerčních setů.
HBV, HAV, HCV, a další viry vyvolávající hepatitidy Herpetické viry - HSV1,2, CMV, EBV, HHV6, HHV8, VZV Chřipka a další respirační viry HIV, HPV Virové gastroenteritidy - rotaviry, noroviry, astroviry Rubeolla, příušnice, spalničky
Virové infekce CNS – klíšťová encefalititda, JCV
Infekce nově se objevující a rekurentní – Zika, Dengue, Virus žluté zimnice
Zoonózy - virus vztekliny, virus chřipky savců a ptáků, paramyxoviry
Hospodářsky významné virové infekce zvířat - pestiviry, virus slintavky a kulhavky, virus Newcastelské choroby ptáků
Infekce psů a koček (herpesviry, kaliciviry)
Last update: Tachezy Ruth, prof. RNDr., Ph.D. (13.01.2026)
