Practical course of diagnostic methods in virology - MB140C85

• Title: Praktikum z vybraných diagnostických metod ve virologii
• Czech title: Praktikum z vybraných diagnostických metod ve virologii
• Guaranteed by: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2024
• Semester: winter
• E-Credits: 3
• Examination process: winter s.:
• Hours per week, examination: winter s.:0/1, C [TS]
• Capacity: 8
• Min. number of students: 6
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Level: specialized
• Note: enabled for web enrollment
• Guarantor: RNDr. Jana Šmahelová
• Teacher(s): RNDr. Ingrid Poláková, Ph.D.; RNDr. Martina Saláková, Ph.D.; RNDr. Jana Šmahelová
• Co-requisite : {At least one of the following subjects: MB140P75, MB140P81}
• Incompatibility : MB140C69E
• Is incompatible with: MB140C69E

Annotation

English

This practical course will focus on molecular methods of viral detection in clinical specimens including the
interpretation of results. The methods will include extraction of nucleic acids from different type of clinical material. The students will analyze the quality and quantity of nucleic acids. They will also detect the selected genes by the polymerase
chain reaction (PCR) and/or real time PCR. The specificity of amplicons will be confirmed by sequencing.
For the detection of viral specific antibodies Enzyme-Linked Immunosorbent
Assay (ELISA) and/or indirect immunofluorescence method will be used.
The course will be held in BIOCEV, Vestec from Oct 29th to Nov 04th

Last update: Poláková Ingrid, RNDr., Ph.D. (03.09.2024)

Czech

Jedná se o pokročilý týdenní kurz, předpokladem je znalost základů virologie a elementární dovednosti v laboratoři.

Praktika jsou zaměřena na výuku vybraných metod používaných pro detekci virů v klinických materiálech včetně interpretace získaných výsledků. Metody budou zahrnovat izolaci nukleových kyselin z různého typu klinických materiálů. Studenti provedou analýzu kvantity a kvality izolovaných nukleových kyselin. Dále budou detekovat vybrané geny metodou klasické polymerázové řetězové reakce (PCR) a/nebo PCR v reálném čase. Specificita amplifikovaných sekvencí bude ověřena sekvenací.
Virově specifické protilátky budou analyzovány testem ELISA (z angl. Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay) a/nebo metodou nepřímé imunofluorescence.

Termín kurzu: 29.10.-04.11.2024 od 8.30 do 16.30 hodin. Místo konání: laboratoře BIOCEV, Vestec

Last update: Šmahelová Jana, RNDr. (13.09.2024)

Literature

English

See MB140P75

Last update: Poláková Ingrid, RNDr., Ph.D. (03.09.2024)

Czech

Viz. MB140P75

Last update: Šmahelová Jana, RNDr. (06.09.2022)

Requirements to the exam

 The course will be held in BIOCEV, Vestec from Oct 29th to Nov 04th 

In order to obtain credits the students have to provide the protocols per each group (2 students per group). The protocols have to include interpretation of the results. 

Last update: Poláková Ingrid, RNDr., Ph.D. (03.09.2024)

Syllabus

English

Direct methods - PCR, qRT PCR, sequencing

Indirect methods - imunofluorescence, ELISA

 

Emphasis will be on good clinical practice. The course will mimic the situation in the clinical laboratory. 

Last update: Poláková Ingrid, RNDr., Ph.D. (29.08.2022)

Czech

Přímé metody - PCR, qRT PCR, sekvenace

Nepřímé metody - imunofluorescence, ELISA

 

Důraz na správnou klinickou praxi. Simulace situace v klinické laboratoři. 

Last update: Poláková Ingrid, RNDr., Ph.D. (29.08.2022)