One week course from molecular biology and virology provides both practical and theoretical training in laboratory
methods from molecular biology and virology. The selected experiments allow students to practice not only basic
methods (like DNA isolation, gel electrophoresis) but also methods more advances, which are used in biomedical
research and diagnostics laboratories (like electron microscopy, PCR, sequencing). Laboratory course is well
suited for students interested in molecular biology and virology.
Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (08.01.2024)
INFORMACE PRO LETNÍ SEMESTR 2023/2024
Praktikum probíhá jako týdenní praktický kurz.
Je naplánován od 20.5. do 24.5.2024, v místnosti praktika v BIOCEVu vždy od 9:00 hod.
S pozdravem
Vojtěch Šroller a kol.
Moodle - Praktikum molekulární biologie a virologie MB140C77
https://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=3944
Týdenní turnusový kurz z molekulární biologie a virologie poskytuje praktický a teoretický nácvik laboratorních
metod z molekulární biologie a virologie. Vybrané úlohy umožňují studentům se seznámit jak se základními
metodami (jako izolace DNA, gelová elektroforéza) tak i s metodami pokročilejšími, které jsou používány ve
výzkumných a diagnostických laboratořích věnující se biomedicínskému výzkumu (např. Elektronová mikroskopie,
PCR, sekvenování). Laboratorní kurz je vhodný především pro studenty se zaměření na molekulární biologii a
virologii.
Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (08.01.2024)
Literature -
Brown T.A. (2006, 2010) Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction; Willey-Blackwell
Sambrook J., Russell D.W., (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, third edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press
Vondrejs V. (1997, 2001, 2003), Genové inženýrství I-III, Karolinum
Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (25.10.2019)
Brown T.A. (2006, 2010) Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction; Willey-Blackwell
Sambrook J., Russell D.W., (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, third edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press
Vondrejs V. (1997, 2001, 2003), Genové inženýrství I-III, Karolinum
Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (25.10.2019)
Requirements to the exam -
credit based on written protocols
Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (30.08.2019)
Zápočet na základě odevzdaných protokolů
Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (30.08.2019)
Syllabus -
The work schedule of practical course:
1. Isolation of DNA, RNA and proteins from mouse cell line, measuring concentration and purity (spectrophotometry)
2. Isolation of bacterial plasmid DNA, visualization on gel electrophoresis, restriction analysis, methods for cloning of genes.
3. Detection of virus specific antibodies in pigs’ sera, using hemagglutination and neutralization inhibition test.
4. Visualization of pseudovirions by electron microscopy.
5. Isolation and detection viral DNA from skin using methods rolling cycle amplification, PCR multiplex amplification, sequencing and identification of DNA by computer analysis.
Last update: Lichá Irena, RNDr., CSc. (26.05.2017)
Úlohy řešené v průběhu praktik:
1. Izolace DNA, RNA a proteinů z buněčné linie myších buněk, měření jejich množství a čistoty (spektrofotometrie).
2. Izolace bakteriálních vektorů, vizualizace na gelové elektroforéze, restrikční analýza, metody klonování genů.
3. Detekce virus-specifických protilátek v prasečím séru pomocí hemaglutinačního a neutralizačně inhibičního testu.
4. Vizualizace pseudovirionů pomocí elektronové mikroskopie.
5. Izolace a detekce virové DNA z povrchu kůže za použití metod amplifikace rolujícím kruhem, amplifikace PCR (multiplex), sekvenace a identifikace získané DNA porovnáním s databázemi.
Last update: Lichá Irena, RNDr., CSc. (26.05.2017)
