Two-week group practical classes are designed to illustrate the topics covered in the lecture and to train students with diploma specialization in virology. Students gain familiarity with the fundamental laboratory methods commonly used not only in virology (work with cell cultures, isolation, purification and quantification of viruses, analyses of viral products) and with the use of viruses in the molecular biology (baculovirus expression vectors) and biomedicine.
Last update: Španielová Hana, RNDr., Ph.D. (24.10.2019)
V akademickém roce 2026/2027 je kurz předběžně plánován od 23.11.do 4.12.2026 v budově BIOCEVu
Dvoutýdenní turnusový kurz, který po metodické stránce rozšiřuje přednášky z virologie, je určen pro studenty s diplomním zaměření virologie a molekulární biologie. V průběhu kurzu se studenti teoreticky i prakticky seznamují se základními metodami používanými nejen ve virologii (práce s tkáňovými kulturami, izolace, purifikace a kvantifikace viru, analýza virových produktů) a možnostmi využití virů v molekulární biologii (bakulovirový expresní systém) i biomedicínských oborech; součástí kurzu je i trénink návyků nutných pro práci s patogeny v laboratoři s úrovní technického zabezpečení 2 (ÚTZ-2).
Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (25.08.2026)
Literature -
David R. OďReilly, Lois K. Miller, Verne A. Luckov: Baculovirus Epression Vectors: a laboratory manual, W.H. Freeman and Company, New York 1992.
Bernard N. Fields, David M. Knipe, Peter M. Howley: Fundamental Virology 3rd ed, Lippincott-Raven, Philadelphia 1996.
Last update: Španielová Hana, RNDr., Ph.D. (24.10.2019)
Literatura:
David R. OďReilly, Lois K. Miller, Verne A. Luckov: Baculovirus Epression Vectors: a laboratory manual, W.H. Freeman and Company, New York 1992.
Bernard N. Fields, David M. Knipe, Peter M. Howley: Fundamental Virology 3rd ed, Lippincott-Raven, Philadelphia 1996.
Martin Krčmář, Beda Břicháček: Molekulárně biologické metody ve virologické diagnostice, IDVPZ Brno, 1993.
Last update: SRBA (19.08.2002)
Course assessment methods and requirements for successful completion, grading scheme -
Requirements - assesment methods and criteria linked to learning outcomes: The course-unit credit is awarded on condition of having attended the practice (4 hours of excused absence during the whole practice). To obtain the credit, it is also necessary to pass the final test with 75% success rate, hand in solving theoretical problem tasks and a protocol to practical tasks in the prescribed term and form. These documents can be returned only after consultation for revision only once.
Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (13.09.2024)
Podmínky splnění předmětu:
Udělení zápočtu je podmíněno aktivní účastí na praktiku (jsou povolené 4 hodiny řádně omluvené absence během celého turnusového praktika). Pro získání zápočtu je dále třeba absolvovat výstupní test se 75% úspěšností (cca 9 otevřených testových otázek), odevzdat protokol k praktickým úlohám v předepsaném termínu a formě Tyto dokumenty lze vrátit po konzultaci k přepracování pouze jednou, při opakovaných nedostatcích nebude zápočet udělen.
Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (26.08.2026)
Syllabus -
The lectures are given in Czech language only.
Practical course in virology takes place as a two-week tournament. The course is designed for students in virology and molecular biology. The capacity of one course is a maximum of 18 students and is limited by the difficulty of the methods performed. During the course, students will learn how to work with infectious biological material in a laboratory with the biosafety level 2 (BSL-2) and learn the habits necessary to work with potential human pathogens. Within the course there are 3 model practical tasks, which are conceived so as to methodically represent problems that the student can encounter in basic research and biomedical fields. It is ensured that the methodologies carried out do not overlap with the content of practical courses in molecular biology and genetics, but become an extension of these courses. The course also includes a series of short lectures on the theoretical foundations of methods and viral expression systems.
Task No. 1: VIRUS QUANTIFICATION IN A STOCK INOCULUM. Procedure and methods: working with tissue cultures and mastering laboratory practices for handling infectious material in the ÚTZ-2 laboratory; comparison of several virus quantification methods: plaque titration, titer determination via immunofluorescence, limiting dilution assay, observation of infection symptoms, and viral genome quantification via qPCR.
Task No. 2: PREPARATION AND PURIFICATION OF VLPs (VIRUS-LIKE PARTICLES) AND INVESTIGATION OF INTERACTIONS BETWEEN VIRAL PARTICLES AND THE HOST CELL. Procedure: Preparation of VLPs using a baculovirus expression system and analysis of the interaction between isolated VLPs and the host cell under various conditions. Methods: VLP isolation and purification (via CsCl gradient ultracentrifugation), immunodot blot or Western blot, VLP quantification via hemagglutination, protein content determination. Sample contrasting via negative staining, electron microscopy, immunofluorescence, or flow cytometry.
Students can access information and study materials on Moodle at http://dl.cuni.cz/.
Course completion requirements: Credit is awarded based on active participation in the practical course (a maximum of 4 hours of duly excused absence is permitted for the duration of the intensive practical course). To obtain credit, students must also pass a final test with a score of at least 75% and submit reports on the practical tasks by the prescribed deadline and in the required format. These documents may be returned for revision once following consultation; credit will not be awarded if deficiencies persist.
Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (26.08.2026)
Praktický kurz z virologie probíhá jako dvoutýdenní turnusové cvičení. Kurz je určen pro studenty s diplomním zaměřením virologie a molekulární biologie. Kapacita jednoho kurzu je maximálně 18 posluchačů a je limitována náročností prováděných metod. V průběhu kurzu se posluchači naučí pracovat s infekčním biologickým materiálem v laboratoři s úrovní technického zabezpečení 2 (ÚTZ-2) a osvojí si návyky nutné pro práci s potenciálními lidskými patogeny. V rámci kurzu probíhají 2 modelové praktické úlohy, které jsou koncipovány tak, aby metodicky reprezentovaly problémy se kterými se posluchač může setkat v základním výzkumu i biomedicínckých oborech. Je dbáno o to, aby se prováděné metodiky příliš nepřekrývaly s náplní praktických kurzů z molekulární biologie a genetiky, ale aby se staly nadstavbou těchto kurzů. Součástí kurzů je také série krátkých přednášek o teoretických základech použitých metod a virových expresních systémech.
Úloha č.1: KVANTIFIKACE VIRU V ZÁSOBNÍM INOKULU. Postup a metody: práce s tkáňovými kulturami a osvojení návyků při práci s infekčním materiálem v laboratoři ÚTZ-2, srovnání několika metod kvantifikace viru, plaková titrace, určení titru pomocí imunofluorescence, metoda konečného ředění, pozorování projevů infekce, kvantifikace virových genomů qPCR
Úloha č. 2: PŘÍPRAVA A PURIFIKACE VLPs (VIRUS-LIKE PARTICLES) A VÝZKUM INTERAKCÍ MEZI VIROVÝMI ČÁSTICEMI A HOSTITELSKOU BUŇKOU. Postup: Příprava VLPs pomocí bakulovirového expresního systému a analýza interakce izolovaných VLPs s hostitelskou buňkou za různých podmínek. Metody: izolace a purifikace VLPs (ultracentrifugací v CsCl gradientu), imunodotblot nebo Western blot, kvantifikace VLPs hemaglutinací, stanovení množství proteinů. Kontrastování vzorku metodou negativního barvení, elektronová mikroskopie, imunofluorescence nebo průtoková cytometrie.
Informace a výukové materiály získají studenti na moodle http://dl.cuni.cz/.
Podmínky splnění předmětu: Udělení zápočtu je podmíněno aktivní účastí na praktiku (jsou povolené 4 hodiny řádně omluvené absence během celého turnusového praktika). Pro zíkání zápočtu je dále třeba absolvovat výstupní test se 75% úspěšností, odevzdat protokoly k praktickým úlohám v předepsaném termínu a formě. Tyto dokumenty lze vrátit po konzultaci k přepracování pouze jednou, při opakovaných nedostatcích nebude zápočet udělen.
Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (26.08.2026)
Learning outcomes - Czech
Po absolvování předmětu student/ka:
Vysvětlí principy základních virologických a metod, zejména metod virové kvantifikace (plaková titrace, imunofluorescenční barvení, metoda konečného ředění, kvantitativní polymerázová řetězová reakce, hemaglutinace), centrifugace, elektronové mikroskopie, bakulovirového expresního systému a jejich využití ve výzkumné, lékařské a biotechnologické praxi.
Samostatně provede vybrané základní laboratorní postupy, jako je práce s hmyzími a savčími tkáňovými kulturami, fixace a imunofluorescenční barvení buněk, infekce buněk viry, fluorescenční mikroskopie, kvantitativní PCR, negativní barvení vzorku pro elektronovou mikroskopii, centrifugace a purifikace pseudovirionů, hemaglutinace a dodržuje zásady správné laboratorní praxe.
Dokáže analyzovat a interpretovat experimentální výsledky, včetně pořízení a vyhodnocení snímků z fluorescenčního mikroskopu, jednoduchých i složitějších výpočtů podle vzorečků u kvantifikačních metod a srozumitelně je zpracovat ve formě laboratorního protokolu.
Využívá základní bioinformatické nástroje a veřejné databáze, pro vyhodnocení kvantitativní PCR a kontrolu výpočtů, a řešení jednoduchých teoretických úloh ve virologii.
Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (16.01.2026)
