Practical course of genetics of prokaryotes - MB140C13

• Title: Praktikum z genetiky prokaryot
• Czech title: Praktikum z genetiky prokaryot
• Form of teaching: block practicals
• Guaranteed by: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2025
• Duration in semesters: 1
• Semester: summer
• E-Credits: 3
• Examination process: summer s.:
• Hours per week, examination: summer s.:0/1, C [TS]
• Capacity: 12
• Maximum number of enrolled students: 12
• Min. number of students: 4
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Level: basic
• Explanation: jednotýdenní turnusové praktikum
• Note: enabled for web enrollment
• Guarantor: RNDr. Jaroslav Nunvář, Ph.D.
• Teacher(s): RNDr. Jaroslav Nunvář, Ph.D.; RNDr. Michaela Schierová, Ph.D.
• Pre-requisite : {At least one of the following subjects: MB140P33, MB140P26, MB140C88}
• Co-requisite : MB140P13

Annotation

English

The course complements the theoretical lecture MB140P13. The three experimental tasks introduce selected principles and methods in bacterial genetics: spontaneous and induced mutagenesis, nonspecific insertional mutagenesis and conjugative mapping.

Last update: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (03.01.2024)

Czech

Praktický kurz doplňuje teoretické znalosti získané na přednášce Genetika prokaryot MB140P13. Na třech úlohách budou demonstrovány vybrané základní principy a metody bakteriální genetiky: spontánní a indukovaná mutageneze, nespecifická inzerční mutageneze a práce s genomovými sekvencemi.

Last update: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (15.01.2026)

Literature

English

E-textbook with detailed descriptions of particular experiments are available on the MOODLE portal.

Last update: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (03.01.2024)

Czech

Prezentace a protokoly s detailním popisem úloh jsou k dispozici na portálu MOODLE na stránkách příslušného předmětu.

Last update: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (09.01.2024)

Course assessment methods and requirements for successful completion, grading scheme

Credits are given on the basis of active partipcipation of the course and presentation protocols of experiments. Protocols should be written up by each student and should have the standard scheme: the objective, principle and task execution, results and discussion of results.

Last update: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (03.01.2024)

Syllabus

English

Task 1: Nonspecific insertional mutagenesis.

Task 2: Spontaneous and induced mutagenesis.

Task 3: Conjugative mapping.

 

Last update: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (03.01.2024)

Czech

Úloha 1: Nespecifická inzerční mutageneze.

Cílem úlohy je pomocí inzerční inaktivace genů fágem MudI(Ap,lac) připravit auxotrofní mutanty a mutanty v genech, jejichž exprese je ovlivněna NaCl.

Úloha 2: Spontánní a indikovaná mutageneze.

Cílem úlohy je kvantifikovat spontánní mutagenní procesy B. subtilis a zhodnotit mutagenní potenciál peroxidu vodíku a ethidium bromidu.

Úloha 3: Bioinformatická analýza genomových sekvencí

Cílem úlohy je demonstrovat (vizualizovat) některé globální charakteristiky bakteriálních genomů a detekovat a charakterizovat genomové ostrovy - vše s využitím dostupných online nástrojů.

Last update: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (20.03.2026)

Learning outcomes

Po absolvování předmětu student:

• vysvětlí principy vybraných technik využívaných v genetice bakterií (nespecifická mutageneze, selekce mutantů, vizualizace exprese pomocí reportérovou fúzí).
• interpretuje získané experimentální výsledky a srozumitelně je zpracovává ve formě laboratorního protokolu.
• využívá základní bioinformatické nástroje a veřejné databáze pro vizualizace a jednoduché analýzy bakteriálních genomů a genetických elementů.
• dokáže zodpovědět teoretické otázky související s tématy experimentálních úloh.

Last update: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (17.01.2026)