Please note, the lectures are given in Czech language. English version of the course can be requested in advance if there are at least 3 students. Aim of the subject is to provide information on the content and building of information sources concerning biodiversity, especially its botanical part. Information will be provided on international standards for taxonomical databases, on available sources concerning biodiversity on Internet (on nomenclature, distribution of plants, bibliographic resources, etc.), on related international projects (BioCASE, ENBI, GBIF, Species Plantarum - Flora of the World), on interactive identification keys. Students are expected to be acquainted with the basic software, which is used for building databases as well as for providing data via Internet.
Last update: Kubátová Gabriela, PhDr., Ph.D. (13.04.2006)
Cieľom predmetu je oboznámiť študentov s obsahom a tvorbou informačných zdrojov o biodiverzite, najmä o jej botanickej zložke. Predmet poskytne informácie o medzinárodných štandardoch tvorby taxonomických databáz, o dostupných zdrojoch informácií týkajúcich sa biodiverzity na internete (o nomenklatúre, rozšírení rastlín, bibliografických zdrojoch, atď.), o súvisiacich medzinárodných projektoch (BioCASE, ENBI, GBIF, Species Plantarum - Flora of the World), o interaktívnych určovacích kľúčoch. Študenti by sa mali oboznámiť aj so základným softvérom, ktorý sa používa na tvorbu databáz a na sprístupnenie ich obsahu prostredníctvom internetu.
Last update: SUDA (29.09.2003)
Literature -
Stuessy, T. F. & Lack, H. W., eds, 2011, Monographic plant systematics: Fundamental assessment of plant biodiversity, Ruggell: A. R. G. Gantner Verlag K. G.
Last update: Marhold Karol, prof. RNDr., DrSc. (26.04.2012)
Stuessy, T. F. & Lack, H. W., eds, 2011, Monographic plant systematics: Fundamental assessment of plant biodiversity, Ruggell: A. R. G. Gantner Verlag K. G.
Last update: Marhold Karol, prof. RNDr., DrSc. (26.04.2012)
Course assessment methods and requirements for successful completion, grading scheme -
oral examination
Last update: Marhold Karol, prof. RNDr., DrSc. (03.11.2011)
ústní zkouška
Last update: Marhold Karol, prof. RNDr., DrSc. (03.11.2011)
Syllabus -
Botanical informatics as part of the quickly developing biodiversity informatics.
International standards for taxonomic databases (TDWG - Taxonomic Databases Working Group).
Major international projects and international organisations in biodiversity informatics (.BioCASE, ECAT, ENBI, GBIF ?)
Information sources available via Internet (nomenclature, distribution data, and bibliographic information).
Standardisation of morphological characters; program DELTA and its use; creating the interactive keys; examples of interactive identification keys from various groups of organisms.
Digitalisation of unit data from herbarium collections, national and international projects; ABCD, Darwin Core - schemas enabling exchange of collections unit data.
Metadata and their description.
Basic software used for building databases as well as for providing data via Internet.
Last update: SUDA (29.09.2003)
Botanická informatika ako časť rozvíjajúcej sa disciplíny "biodiversity informatics".
Medzinárodné štandardy na tvorbu taxonomických databáz (TDWG - Taxonomic Databases Working Group).
Medzinárodné projekty a medzinárodné organizácie (BioCASE, ECAT, ENBI, GBIF ?) v oblasti informačných zdrojov o biodiverzite.
Informačné zdroje na internete (nomenklatúra, rozšírenie druhov rastlín, bibliografické informácie).
Štandardizácia morfologických znakov, program DELTA a jeho použitie; tvorba interaktívnych určovacích kľúčov; príklady interaktívnych určovacích kľúčov z rôznych skupín organizmov.
Digitalizácia jednotkových údajov z herbárových zbierok, národné a medzinárodné projekty; ABCD, Darwin Core - schémy (štandardy) umožňujúce výmenu jednotkových údajov o zbierkach.
Metadáta a ich popis.
Základné druhy softvéru na tvorbu databáz a ich sprístupnenie prostredníctvom internetu.
