Methods in cryptogamology - MB120C77B

• Title: Methods in cryptogamology
• Czech title: Metody studia v kryptogamologii
• Guaranteed by: Department of Botany (31-120)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2020
• Semester: winter
• E-Credits: 3
• Examination process: winter s.:
• Hours per week, examination: winter s.:1/2, C [HT]
• Capacity: unlimited
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: cancelled
• Language: English
• Explanation: nahrazen MB120C118
• Note: enabled for web enrollment
• Guarantor: doc. Mgr. Ondřej Koukol, Ph.D.
• Is incompatible with: MB120C118

Annotation

English

Last update: doc. Mgr. Ondřej Koukol, Ph.D. (29.04.2015)

The course covers introduction to basic methods used for studying different members of fungi, lichens and bryophytes. The course includes work in laboratory (principles of aseptical work, isolation techniques, cultivation techniques), herbaria and libraries, preparation of culture media and macro- and microphotographs, data sampling, storing and evaluating, dying methods, material documentation, etc. Search for relevant literature and preparation of manuscript, theses, posters, etc., is also included.

The course runs in English if at least one non-Czech student is enrolled.

Czech

Last update: RNDr. David Svoboda, Ph.D. (03.10.2019)

Základní metody studia hub, lišejníků a mechorostů. Důraz je kladen jak na teoretickou část zahrnující výběr,
vyhledávání a zpracování literatury, tak na praktickou část jako je aseptická práce v labotatoři, terénu, zhotovování
dokumentační makro- i mikrofotografií, prezentace vlastních výstupů (powerpointová prezentace, sepisování
diplomových prací a publikací).
Pokud nejsou zapsáni anglicky mluvící studenti, bude výuka probíhat v češtině.
Některé materiály: https://botany.natur.cuni.cz/svoboda/prednasky/Methods_in_cryptogamology/

Requirements to the exam

Last update: doc. Mgr. Ondřej Koukol, Ph.D. (06.12.2011)

Zápočet je udělen za pravidelnou docházku a zhodnocení formy, využitelnosti a aktuálnosti obsahu jednotlivých kapitol ve finálním dotazníku týkajícím se jednotlivých lekcí.

Syllabus

English

Last update: RNDr. David Svoboda, Ph.D. (11.03.2008)

Common techniques:

Preparation of natural media as well as agar media. Sterilization and disinfection. Media for cultivation and media for determination.

Special techniques in mycology:

Isolation methods of cultivated fungi from different substrata. Methods of cultivation. Preservation and storage of saprotrophic fungi in collection. Preparation for optical microscopy: monosporic isolation, agar blocks, microscope slides with agar, moist chambers, staining, preparation of permanent slides etc.

Ascomycetes - direct study of natural material.

Methods for study of plant pathogens: collection, preservation, determination, inoculation experiments. Methods of pathometry. Analyses of important fungal pathogens populations.

Special techniques in bryology.

Collecting of bryophytes and preparation of herbarium material. Determination of bryophytes. Review of basic bryological literature, exsiccates. Cultivation methods. Cytology - study of mitotic and meiotic karyotypes.

Special techniques in lichenology.

Preparation of herbarium material. Chemistry of lichens (spot reactions, extraction and recrystalisation of lichen substances).

Technique for microscopy.

Microscope calibration, phase contrast, DIC.

Documentation techniques.

Drawings, nondigital photomicrography. Black and white photos developing. Photografy of cryptogamologic micro- and macroobjects.

Literature, evaluation of data.

References [rules]. Searching of literature. Preparation of manuscripts. Typography [not only by computer]. Proof-reading. Internet. Library. Basic literature for determination. Evaluation of data by statistic methods. Graphs.

Czech

Last update: RNDr. David Svoboda, Ph.D. (11.03.2008)

Práce s literaturou

Pravidla citace literatury. Literární rešerše. Korektury a typografie. Internetové zdroje literatury. Práce v katedrové knihovně. Ostatní důležité knihovny. Meziknihovní výměna.

Mikroskopická technika

Proměření mikroskopu a měřítka. Čištění optiky. Polarizační světlo. Temné pole.

Köhlerův princip. Fázový kontrast. Nomarského diferenciální interferenční kontrast (DIC).

Dle zájmu a času: Elektronový mikroskop QUANTA FEI , Inverzní mikroskop (IBOT ).

Kultivační techniky v mykologii

Příprava živných přírodních i umělých agarových médií. Kultivační metody hub. Vlhké komůrky. Kultivační a determinační média. Uchovávání živých kultur saprotrofních hub ve sbírkách. Vlastní očkování, aseptická práce v boxu. Monosporické izolace. Barvení a mikroskopování houbových preparátů. Literatura o vláknitých houbách, určování.

Zakládání pokusů, sběr dat

Sampling design, faktoriální design, kontrola, negativní kontrola, počty opakování, nezávislá opakování. Záznamy o sběrech. Statistické vyhodnocování výsledků. Tabulky a grafy v písemných výstupech, samovysvětlující legendy.

Askomycety a houby saprotrofní sbírané

Řez apotheciem, peritheciem, mikroskopování vřecek, mycelia a konidií hyfomycetů, coelomycetů, plodnice v lichenologii. Příprava trvalých preparátů. Určovací literatura.

Parazitické houby

Zakládání infekčních pokusů, vyhodnocování. Konzervace, určování. Literatura.

Speciální techniky v bryologii

Určování, herbářování, exsikáty. Kultivační metody při studiu mechorostů, cytologie - studium mitotických a meiotických karyotypů u mechorostů. Literatura.

Speciální techniky v lichenologii

Preparace herbářového materiálu, chemismus lišejníků. Určovací literatura, floristické údaje, časopisy, databáze internet.

Dokumentační technika

Mikro- a makrofotografie kryptogamologických objektů. Kreslení. Zpracování obrazu v PC.

Prezentace a vlastní výstupy

PowerPoint. Poster. Psaní rukopisů (úvod, materiál a metodika, výsledky, diskuse, poděkování, abstrakt).