As part of the practical exercises, students will study other methods of preparative chromatography for the isolation of pure compounds from fractions obtained from the previous semester within the Laboratory of Phytochemical Methods I., namely the use of preparative HPLC. An integral part of the isolation of pure compounds is their subsequent identification using tandem methods (GC-MS, HPLC-MS), physical and chiroptical methods. Students will also optimize the possibility of changing the structures of isolated substances to achieve increased solubility, stability, detection and biological activity, or bioavailability. An integral part of the practical exercises is the subsequent in silico evaluation of isolated compounds.
Last update: Rydval Miroslav, Ing. (08.07.2025)
V rámci praktických cvičení si studenti osvojí další metody preparativní chromatografie pro izolaci čistých sloučenin z frakcích získaných z předešlého semestru v rámci Laboratoře z fytochemických metod I., a to použití preparativní HPLC. Nedílnou součásti izolace čistých sloučenin je i jejich následná identifikace pomocí tandemových metod (GC-MS, HPLC-MS), fyzikálních i chiroptických metod. Studenti si osvojí i možnost obměny struktur izolovaných látek pro dosažení zvýšení solubility, stability, detekce a biologické aktivity, případně biodostupnosti. Nedílnou součástí praktických cvičení je následné in silico zhodnocení izolovaných sloučenin.
Last update: Rydval Miroslav, Ing. (08.07.2025)
Course completion requirements -
100% attandance in practical classes.
Last update: Rydval Miroslav, Ing. (08.07.2025)
Podmínkou je 100% účast na praktických cvičeních.
Last update: Rydval Miroslav, Ing. (08.07.2025)
Literature - Czech
Doporučená:
OPLETAL, L., DRAŠAR, P.. Fytochemické metody. 1. Izolace obsahových látek (laboratorní technika). Praha: Karolinum, 1994, s. ISBN .
Ikan, R.. Natural Products. A Laboratory Guide.. London: Academic Press, 1991, s. ISBN .
COLEGATE, M.S., MOLYNEUX, R.J.. Bioactive natural products: detection, isolation, and structural determination.. Boca Raton: CRC Press, Taylor & Francis Group, 2008, s. ISBN .
Last update: Rydval Miroslav, Ing. (08.07.2025)
Teaching methods -
Practical classes.
Last update: Rydval Miroslav, Ing. (08.07.2025)
Praktická cvičení.
Last update: Rydval Miroslav, Ing. (08.07.2025)
Syllabus -
1. HPTLC-MS analysis of fractions
2. Preparative chromatography of fractions
3. GC, HPLC analysis
4. Physical methods of isolate identification
5. Chiroptical methods of natural substance identification
6. Derivatization of secondary plant metabolites
7. In silico evaluation of achieved results
Last update: Rydval Miroslav, Ing. (08.07.2025)
1. HPTLC-MS analýza frakcí
2. Preparativní chromatografie frakcí
3. GC, HPLC analýza
4. Fyzikální metody identifikace izolatů
5. Chiroptické metody identifikace přírodních látek
6. Derivatizace sekundárních metabolitů rostlin
7. In silico evaluace dosažených výsledků
Last update: Rydval Miroslav, Ing. (08.07.2025)
Learning outcomes -
Prerequisite: theoretical knowledge of the subject Phytochemical Methods (GAPL002). Knowledge of analytical chemistry, organic chemistry.
The subject Laboratory of Phytochemical Methods II. builds on the knowledge and skills acquired in the subjects Phytochemical Methods, Laboratory of Phytochemical Methods I., Chemistry of Natural Substances I., Chemistry of Natural Substances II. The graduate of the practical exercises is familiar with the use of preparative HPLC for the isolation of pure substances from mixtures/fractions obtained by Flash chromatography, or by other separation techniques. The student has practical skills in the identification of isolated compounds using tandem methods (GC-MS, HPLC-MS), physical and chiroptical methods. Students can modify the structure of isolated substances to achieve increased solubility, stability, detection and biological activity, or bioavailability. The graduate of the practical exercises can evaluate isolated compounds using in silico methods (work with databases, software).
Learning outcomes: Based on the acquired knowledge and skills, the student:
will design a method for the separation of substances using preparative HPLC, including method development, setting parameters in the software, including evaluation of separation, identification, and purity of the isolated compound
will identify isolated compounds using tandem methods (GC-MS, HPLC-MS), physical and chiroptical method.
knows the principles of preparing derivatives of isolated compounds to achieve increased solubility, stability, detection and biological activity, or bioavailability
evaluate and interpret isolated compounds using in silico methods (work with databases, software)
Last update: Rydval Miroslav, Ing. (08.07.2025)
Předmět Laboratoř z fytochemických metod II. navazuje na znalosti a dovednosti získané v předmětech Fytochemické metody, Laboratoř z fytochemických metod I., Chemie přírodních látek I., Chemie přírodních II.
Absolvent praktických cvičení má osvojené používání preparativní HPLC pro izolací čistých látek ze směsí/frakcí získaných Flash chromatografii, případně jinou separační technikou. Student má praktické dovednosti v identifikaci izolovaných sloučenin použitím tandemových metod (GC-MS, HPLC-MS), fyzikálních i chiroptických metod. Studenti umí obměnit strukturu izolovaných látek pro dosažení zvýšení solubility, stability, detekce a biologické aktivity, případně biodostupnosti. Absolvent praktických cvičení dokáže zhodnotit izolované sloučeniny in silico metodami (práce s databázemi, softwary).
Výsledky učení:
Studující na základě získaných znalostí a dovedností:
navrhne metodu separace látek pomocí preparativní HPLC včetně vývoje metody, nastavení parametrů v softwaru, včetně vyhodnocení separace, identifikace, čistoty izolované sloučeniny.
provedou identifikaci izolovaných sloučenin použitím tandemových metod (GC-MS, HPLC-MS), fyzikálních i chiroptických metod.
zná principy přípravy derivátů izolovaných sloučenin pro dosažení zvýšení solubility, stability, detekce a biologické aktivity, případně biodostupnosti.
vyhodnotí a interpretují in silico metodami izolované sloučeniny (práce s databázemi, softwary).
Last update: Rydval Miroslav, Ing. (08.07.2025)
Entry requirements -
Prerequisite: theoretical knowledge of the subject Phytochemical Methods (GAPL002). Knowledge of analytical chemistry, organic chemistry.
Last update: Rydval Miroslav, Ing. (08.07.2025)
Předpoklad teoretických znalostí z předmětu Fytochemické metody (GAPL002). Znalosti analytické chemie, organické chemie.
