Pharmacogenomics of Cancer Diseases and Oncogenomics - EDPECH002

• Title: Farmakogenomika nádorových onemocnění a onkogenomika
• Guaranteed by: Department of science and research (14-260)
• Faculty: Faculty of Medicine in Pilsen
• Actual: from 2019
• Semester: winter
• Points: 0
• E-Credits: 0
• Examination process: winter s.:
• Hours per week, examination: winter s.:4/0, C [HS]
• Capacity: unknown / unknown (unknown)
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Teaching methods: full-time
• Guarantor: RNDr. Mgr. Radka Václavíková, Ph.D.

Annotation

Hlavním cílem předmětu je uvést studenty do teoretických i praktických aspektů studia farmakogenomiky a
onkogenomiky, zejména v souvislosti s léčbou nádorových onemocnění, včetně klinických aplikací a jejich limitací.

Last update: Vyzrálová Daniela, Ing. (21.11.2018)

Literature

Přednáška je založena na zásadních učebnicích a desítkách článků publikovaných ve vědecké literatuře. Prezentace se všemi literárními odkazy jsou k disposici před i po každé přednášce.
Server farmakogenomika.cz

Literatura:

Zhou Y, Lauschke VM. Next-generation sequencing in pharmacogenomics - fit for clinical decision support? Expert Rev Clin Pharmacol. 2024 Mar;17(3):213-223. doi: 10.1080/17512433.2024.2307418.

Fukunaga K, Momozawa Y, Mushiroda T. Update on next generation sequencing of pharmacokinetics-related genes: Development of the PKseq panel, a platform for amplicon sequencing of drug-metabolizing enzyme and drug transporter genes. Drug Metab Pharmacokinet. 2021 Apr;37:100370. doi: 10.1016/j.dmpk.2020.11.005.

Crisafulli C, Romeo PD, Calabrò M, Epasto LM, Alberti S. Pharmacogenetic and pharmacogenomic discovery strategies. Cancer Drug Resist. 2019 Jun 19;2(2):225-241. doi: 10.20517/cdr.2018.008.

Wartman LD. The future of cancer treatment using precision oncogenomics. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2018 Apr 2;4(2):a002824. doi: 10.1101/mcs.a002824

Kinnersley, B., Sud, A., Everall, A. et al. Analysis of 10,478 cancer genomes identifies candidate driver genes and opportunities for precision oncology. Nat Genet (2024). https://doi.org/10.1038/s41588-024-01785-9

Last update: Vyzrálová Daniela, Ing. (30.07.2024)

Syllabus

V první části kurzu se studenti seznámí se základními pojmy a aspekty procesu karcinogeneze a také se základy, charakteristikami a cílem využití farmakogenomiky a onkogenomiky v individualizaci terapie nádorových onemocnění. V další části kurzu se studenti seznámí s různými metodami studia genomiky se zaměřením na moderní technologie sekvenování nové generace, farmakogenetickými interakcemi a v neposlední řadě též s perspektivou a budoucností využití farmakogenomiky a onkogenomiky v klinické praxi.

Last update: Vyzrálová Daniela, Ing. (21.11.2018)