SubjectsSubjects(version: 978)
Course, academic year 2025/2026
   Login via CAS
Microbiology II. - D1105038
Title: Mikrobiologie II.
Guaranteed by: Department of Medical Microbiology (13-323)
Faculty: Second Faculty of Medicine
Actual: from 2024
Semester: winter
Points: 4
E-Credits: 4
Examination process: winter s.:
Hours per week, examination: winter s.:56/0, C+Ex [HT]
Extent per academic year: 14 [weeks]
Capacity: unlimited / unknown (unknown)
Min. number of students: unlimited
4EU+: no
Virtual mobility / capacity: no
Key competences:  
State of the course: taught
Language: Czech
Teaching methods: full-time
Level:  
Guarantor: prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Teacher(s): prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
MUDr. Jakub Kantor
Co-requisite : D1106089
Pre-requisite : D1103040, D1104339
Is co-requisite for: D1106089
Is pre-requisite for: D1108368, D1108038, D1108369, D1108004
Annotation - Czech
Jde o povinný studijní předmět, který patří mezi základní teoretické předměty profilujícího základu. Jeho absolvováním student získá znalosti a dovednosti v oblasti lékařské mikrobiologie – v popisu jednotlivých mikroorganismů a jejich vlastností, v zásadách odběru, transportu a zpracování biologického materiálu, v mechanismu účinku a působení antimikrobních látek, v obecných principech antiinfekční terapie a v poznání interakcí infekčních agens s makroorganismem, které jsou nezbytným předpokladem pro další úspěšné studium ve vyšších ročnících. V rámci předmětu si student osvojí například následující znalosti, dovednosti a kompetence: - zhodnotit laboratorní nálezy, které by mohly mít spojitost s onemocněním způsobeným mikroorganismy - abnormální počet leukocytů, abnormální výsledky analýzy stolice, okultní krvácení, nález parazitů, abnormální močový sediment, zvýšené markery zánětu - pochopit základní patologické stavy, které mohou mít přímou souvislost s působením mikroorganismu v lidském těle - např. lymfadenopatie, horečka, zimnice, svědění, otoky, edémy, hubnutí, akutní těžká bolest hlavy či meningismus - porozumět problematice nozokomiálních infekcí a jejich rizik – ATB rezistence, možnosti diagnostiky a terapie, spolupráce s epidemiologem, bariérová opatření - vnímat mechanismy šíření agens v populaci, zamezení cest přenosu, prevence - otázky týkající se imunizace jedince – očkovací plán; povinná, nepovinná očkování, doporučená očkování - použít základní klinickou rozvahu při získávání informací významných pro pacientovu léčbu. Zahrnout vědecké poznatky teoretických lékařských věd včetně epidemiologických informací (incidence, prevalence) do klinické rozvahy za účelem sestavit diferenciální diagnózu - zhodnotit závažnost obtíží pacienta, symptomů nemoci nebo situace, ve které se pacient nachází. Konzultovat s dalšími lékaři a členy týmu, aby došlo k potvrzení a schválení pracovní diagnózy, vysvětlit a zdokumentovat klinickou rozvahu, jež vedla k pracovní diagnóze; prokázat kritické myšlení vedoucí ke stanovení diferenciální diagnózy. - doporučit vstupní, nákladově efektivní diagnostickou metodu pro pacienta s akutním nebo chronickým onemocněním, nebo jako součást preventivní zdravotní prohlídky. Vyhodnotit výsledky testů a zahrnout je do diferenciální diagnózy. Pochopit důsledky a naléhavost v případě abnormálních výsledků vyšetření a v případě nutnosti požádat o pomoc s jejich výkladem.
Last update: Procházka Zdeněk (04.09.2020)
Course completion requirements - Czech

Zakončení předmětu M II je podmíněno úspěšně složenou ústní zkouškou. K té lze přistoupit po udělení zápočtu za zimní semestr.

1) Úspěšné absolvování písemných testů, tedy zisk minimálně 20 bodů v součtu všech tří průběžných testů. Jednotlivé testy mohou absolvovat studenti před začátkem přednášky (termíny viz dále). Náhradní termíny pro průběžné testy nejsou vypisovány. Každý z jednotlivých testů obsahuje 10 otázek, každá správně zodpovězená otázka je ohodnocena 1 bodem. Doba trvání každého jednotlivého testu je 10 minut. Pokud student nedosáhne na minimální bodové ohodnocení 20 bodů, má možnost uspět v souhrnném opravném testu v zápočtovém týdnu. Test obsahuje 30 otázek, minimum je získání 24 bodů.

Bez splnění uvedené podmínky udělení zápočtu nebude student připuštěn ke zkoušce. Zápočet má platnost jeden kalendářní rok. Neplatí pro studenty, kteří v rámci individuálního studijního plánu mají rozložený ročník.

Termíny zápočtových testů

1. test Obecná mikrobiologie 3. týden zimního semestru (Obecná bakteriologie, virologie, mykologie, parazitologie – základní pojmy, Antimikrobiální látky – přehled, mechanismy účinku i rezistence k ATB, spektrum účinku Vyšetřovací metody – přehled a rozdělení, význam, výhody a nevýhody jednotlivých metod)

2. test Speciální mikrobiologie 6. týden zimního semestru (Bakterie (G+, G- i ostatní), houby, paraziti, viry – znalosti o jednotlivých agens - klasifikace, nejvýznamnější faktory virulence, patogenita, možnosti diagnostiky a terapie)

3. test Klinická mikrobiologie 11. týden zimního semestru (Infekce nosokomiální, močové, respirační, alimentární, nervového systému, krevního řečiště – nejvýznamnější původci, metody diagnostiky, léčby i prevence)

Last update: Laušerová Romana (22.09.2025)
Literature - Czech

Základní studijní literatura :

•Hurych J, Štícha R a kol.: Lékařská mikrobiologie - repetitorium, 3. vydání, Triton, 2021, ISBN 978-80-7553-976-2.

•Melter O et al.: The MicroBook - Clinical Microbiology for Medical Students, 1. vydání, Karolinum, 2019, ISBN 978-80-246-3871-3.

MOODLE:

https://dl1.cuni.cz/course/view.php?id=6510

Last update: Hurych Jakub, MUDr., Ph.D. (01.10.2024)
Requirements to the exam - Czech

Mikrobiologie II :

Pravidla:

Kombinace tří otázek ze tří okruhů:

1. Obecná mikrobiologie (okruh I.)

2. Speciální mikrobiologie (okruhy II.-IV)

3. Klinická mikrobiologie (okruh V.) a Vyšetřovací metody (okruh VI.)

I. Obecná mikrobiologie (26 otázek)

1. Složení buněčné stěny G+ a G- bakterií. Klasifikace bakterií.

2. Stavba bakteriální buňky a povrchové struktury, bakteriální spora.

3. Exotoxiny a jejich rozdělení podle mechanismu a místa účinku.

4. Bakteriální genom a jeho plasticita. Mobilní genetické elementy.

5. Stavba virových částic. Klasifikace virů.

6. Patogeneze virových infekcí.

7. Obecná mykologie. Klasifikace mikromycet.

8. Obecná parazitologie. Klasifikace parazitů.

9. Mechanismy účinku antibiotik.

10. Mechanismy rezistence k antibiotikům.

11. Rezervní antibiotika

12. Zásady racionální antibiotické terapie.

13. Penicilinová antibiotika.

14. Cefalosporiny I. až V. generace, karbapenemy

15. Glykopeptidy. Oxazolidinony (linezolid)

16. Přípravky s inhibitory betalaktamáz

17. Makrolidová a linkosamidová antibiotika.

18. Tetracykliny včetně tigecyklinu. Chloramfenikol.

19. Aminoglykosidy. Polypeptidová antibiotika (polymyxin).

20. Chinolononová antibiotika.

21. Kotrimoxazol. Metronidazol. Nitrofurantoin.

22. Antituberkulotika.

23. Virostatika včetně léčby covid-19.

24. Antimykotika.

25. Antiparazitika (s důrazem na antimalarika) vč. antiinfektiv využívaných k léčbě parazitárních infekcí.

26. Nežádoucí účinky antibiotik.

II. Speciální virologie a mykologie (19 otázek)

27. Herpesviry - HSV1, HSV2 a VZV.

28. Herpesviry - EBV, CMV a HHV-6.

29. Viry influenzy.

30. Virus parotitidy. Virus spalniček.

31. Virus zarděnek a parvovirus B19.

32. Virus vztekliny.

33. Adenoviry.

34. Rotaviry. Caliciviry.

35. Polioviry a jiné enteroviry.

36. Flaviviry způsobující encefalitidy

37. Virové hemoragické horečky.

38. Papilomaviry. Lidské patogenní poxviry.

39. RSV, viry parainfluenzy, rhinoviry.

40. SARS-CoV-2 a další koronaviry

41. Původci virových hepatitid.

42. Virus HIV a jiné retroviry.

43. Kvasinky (kandidy)

44. Vláknité mikromycety (aspergily, mukormycety, dermatofyty).

45. Cryptococcus. Pneumocystis.

III. Speciální bakteriologie (33 otázek)

46. Staphylococcus aureus.

47. Koaguláza negativní stafylokoky.

48. Streptococcus pyogenes.

49. Beta hemolytické streptokoky jiné než S. pyogenes.

50. Streptococcus pneumoniae a ústní streptokoky.

51. Enterokoky.

52. Neurotoxická klostridia.

53. Histotoxická klostridia.

54. Clostridioides difficile.

55. Bacillus anthracis a ostatní bacily.

56. Listeria monocytogenes.

57. Korynebakteria.

58. Aktinomycety a nokardie.

59. Pseudomonas aeruginosa a další G- nefermentující tyčinky.

60. Bordetelly.

61. Brucely a Francisella tularensis. Legionella pneumophila.

62. Campylobacter. Helicobacter pylori.

63. Haemophilus influenzae a ostatní hemofily.

64. Vibrio cholerae a ostatní vibria.

65. Escherichia coli. Shigely.

66. Yersinie.

67. Salmonely (Typhi, Enteritidis a další sérotypy).

68. Klebsiella. Enterobacter.

69. Citrobacter, Serratia, Proteus a Providencia.

70. Neisseria meningitidis.

71. Neisseria gonorrhoeae.

72. Anaerobní bakterie jiné než klostridia a aktinomycety).

73. Treponema pallidum.

74. Borrelie a leptospiry.

75. Rickettsie, coxielly, bartonely.

76. Chlamydie.

77. Mykoplasmata a ureaplasmata.

78. Mykobakteria.

IV. Parazitologie (11 otázek)

79. Trypanosomy a leishmanie.

80. Giardia. Cryptosporidium. Trichomonas.

81. Entamoeba a další améboidní prvoci.

82. Původci malárie.

83. Toxoplasma gondii.

84. Schistosomy.

85. Taeniae a ostatní původci střevních cestodóz.

86. Echinokoky a ostatní původci tkáňových cestodóz.

87. Enterobius a Ascaris. Ostatní původci střevních nematodóz.

88. Trichinella a další původci tkáňových nematodóz (včetně filarióz).

89. Ektoparazité.

V. Klinická mikrobiologie (18 otázek)

90. Lidský mikrobiom. Fyziologická mikrobiota.

91. Infekce horních cest dýchacích.

92. Infekce dolních cest dýchacích.

93. Průjmová onemocnění.

94. Infekce močových cest.

95. Sexuálně přenosné infekce.

96. Nehnisavé (aseptické) neuroinfekce.

97. Hnisavé meningitidy.

98. Infekce krevního řečiště. Pojem sepse.

99. Infekce spojené se zdravotní péčí (healthcare-associated infections).

100. Multirezistentní kmeny a možnosti léčby.

101. Exantémová onemocnění.

102. Infekce kůže a měkkých tkání.

103. Infekce kostí a kloubů.

104. Infekce způsobené anaerobními bakteriemi.

105. Infekce plodu a novorozence.

106. Typy očkovacích látek. Povinné očkování.

107. Doporučené očkování a očkování na žádost jedince.

VI. Vyšetřovací postupy a diagnostika (12 otázek)

108. Mikrobiologická diagnostika bakteriálních infekcí

109. Mikrobiologická diagnostika virových infekcí

110. Mikrobiologická diagnostika mykotických infekcí

111. Mikrobiologická diagnostika parazitárních infekcí

112. Mikroskopie v diagnostice infekčních onemocnění.

113. Kultivace bakterií.

114. Postupy vedoucí k identifikaci bakterií.

115. Testy citlivosti k antibiotikům. Interpretace výsledků

116. Serologické reakce (aglutinace, ELISA, WB, imunochromatografie).

117. Metody molekulární biologie a jejich výhody a nevýhody v diagnostice infekčních onemocnění.

118. PCR a jeho využití v diagnostice infekčních onemocnění (včetně režimu POCT).

119. Sekvenování a jeho využití v mikrobiologické laboratoři.

Last update: Laušerová Romana (18.09.2025)
 
Schedule scheduled
Schedule ticket Date From - To Education type Theme Teacher Files Note
25aD1105038p1

Groups of students
M3.VL
Wed 01.10.2025 14:25 - 16:05 lecture   Úvod. Virologie I: obecné principy, metody diagnostiky prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Thu 02.10.2025 13:30 - 15:10 lecture   Mykologie I: obecné principy, antimykotika, dermatofyta MUDr. Daniela Lžičařová
Wed 08.10.2025 14:25 - 16:05 lecture   Virologie II: Herpesviry  MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Thu 09.10.2025 13:30 - 15:10 lecture   Mykologie II: Kandidóza, kryptokokóza, aspergilóza, mukormykóza, pneumocystová pneumonie MUDr. Daniela Lžičařová
Wed 15.10.2025 14:25 - 16:05 lecture   Parazitologie I: Protozoa - 1.část prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc.
Thu 16.10.2025 13:30 - 15:10 lecture   Parazitologie II: Protozoa - 2.část, Trematoda + ZÁPOČTOVÝ TEST 1 prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc.
Wed 22.10.2025 14:25 - 16:05 lecture   Parazitologie III: Cestoda, Nematoda prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc.
Thu 23.10.2025 13:30 - 15:10 lecture   ATB repetitorium: obecné principy MUDr. Václav Vaniš
Wed 29.10.2025 14:25 - 16:05 lecture   Lidský mikrobiom, fyziologická mikrobiota MUDr. Jakub Hurych, Ph.D.
Thu 30.10.2025 13:30 - 15:10 lecture   Infekce močových cest MUDr. Jakub Hurych, Ph.D.
Wed 05.11.2025 14:25 - 16:05 lecture   Virologie IV: Viry exantémových onemocnění MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Thu 06.11.2025 13:30 - 15:10 lecture   Virologie III: Arboviry; viry hemoragických horeček + ZÁPOČTOVÝ TEST 2 MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Wed 12.11.2025 14:25 - 16:05 lecture   Neuroinfekce prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Thu 13.11.2025 13:30 - 15:10 lecture   Respirační infekce I: bakteriální a mykotičtí původci prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Wed 19.11.2025 14:25 - 16:05 lecture   Respirační infekce II: viroví původci MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Thu 20.11.2025 13:30 - 15:10 lecture   Infekce GIT I: Intestinální patotypy E. coli a shigelly prof. MUDr. Martina Bielaszewska, CSc.
Wed 26.11.2025 14:25 - 16:05 lecture   Infekce GIT II: další bakteriální, viroví a parazitární původci prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Thu 27.11.2025 13:30 - 15:10 lecture   Infekce GIT III: Infekce vyvolané Clostridioides difficile (CDI) Mgr. Marcela Krůtová, Ph.D.
Wed 03.12.2025 14:25 - 16:05 lecture   Úvod do nosokomiálních infekcí, katetrové infekce, ranné infekce, nosokomiální a ventilátorové pneumonie MUDr. Václav Vaniš
Thu 04.12.2025 13:30 - 15:10 lecture   Infekce krevního řečiště  prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Wed 10.12.2025 14:25 - 16:05 lecture   Infekce kostí a kloubů  MUDr. Václav Vaniš
Thu 11.12.2025 13:30 - 15:10 lecture   Infekce kůže a měkkých tkání +  ZÁPOČTOVÝ TEST 3 MUDr. Anežka Gryndlerová
Wed 17.12.2025 14:25 - 16:05 lecture   Pohlavně přenosné infekce I: bakteriální a parazitární původci prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Thu 18.12.2025 13:30 - 15:10 lecture   Pohlavně přenosné infekce II: Virus HIV a viry hepatitid (HBV a HCV) MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Wed 07.01.2026 14:25 - 16:05 lecture   Infekce v těhotenství a infekce u novorozenců prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Thu 08.01.2026 13:30 - 15:10 lecture   MDR bakterie a rezervní antibiotika MUDr. Otakar Nyč, Ph.D.
Wed 14.01.2026 14:25 - 16:05 lecture   Očkování pohledem mikrobiologie prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Thu 15.01.2026 13:30 - 15:10 lecture   Exam essentials: připomenutí základů mikrobiologie a dotazy z publika  MUDr. Jakub Hurych, Ph.D.
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html