VP - Analysis of biomarkers with application in inherited metabolic disorders: a practical course of mass spectrometry - B03577 (elective subject)
Title: VP - Analýza biomarkerů u dědičných metabolických poruch: praktický kurz hmotnostní spektrometrie
Guaranteed by: Department of Pediatrics and Inherited Metabolic Disorders First Faculty of Medicine Charles University and General University Hospital in Prague (11-00650)
Faculty: First Faculty of Medicine
Actual: from 2025
Semester: winter
Points: 3
E-Credits: 3
Examination process: winter s.:
Hours per week, examination: winter s.:0/15, C [HS]
Extent per academic year: 15 [hours]
Capacity: 8
Min. number of students: 2
4EU+: no
Virtual mobility / capacity: no
State of the course: taught
Language: Czech
Teaching methods: full-time
Note: course for students of another faculty
course can be enrolled in outside the study plan
enabled for web enrollment
Guarantor: RNDr. Ladislav Kuchař, Ph.D.
Attributes: Adiktologie
Ergoterapie
Fyzioterapie
Nutriční specialista
Porodní asistentka
Lékařství
Ošetřovatelství
Nutriční terapeut
Všeobecná sestra
Klinický předmět
Zubní lékařství
Opinion survey results   WS schedule   Noticeboard   
Annotation - Czech
Praktický kurz hmotnostní spektrometrie je zaměřen na teoretické seznámení studentů s instrumentací a aplikací hmotnostní spektrometrie v moderní biomedicíně a klinické laboratorní praxi při screeningu a diagnostice lysosomálních onemocnění jako modelovém příkladu dědičných metabolických onemocnění. Studenti se v části zabývající se instrumentací seznámí s pojmy jako elektrosprej, MALDI, kvadrupolový analyzátor, TOF atd. V aplikační teorii budou seznámeni s pojmy biomarker, screening, diferenciální screening/diagnostika, kvantifikace biomarkerů, lysosomální střádavé onemocnění atd. V praktické části budou prakticky seznámení s přípravou vzorků pro hmotnostně spektrometrickou analýzu. Provedou analýzu série anonymních vzorků a vyhodnotí kvantitu sledovaných biomarkerů. Na základě stanovených hodnot biomarkerů následně určí, jestli hodnoty odpovídají modelovému lysosomálnímu onemocnění či nikoliv.
Last update: Holanová Marcela (07.06.2023)
Aim of the course - Czech

Teoreticky seznámit studenty s moderní metodou analýzy biomarkerů u dědičných chorob metabolismu a umožnit jim prakticky vyzkoušet nové znalosti na modelovém onemocnění, kdy na závěr stanoví na základě kombinace kapalinové chromatografie a hmotnostně spektrometrické analýzy vybraných biomarkerů možnou diagnózu dědičného metabolického onemocnění.

Last update: Holanová Marcela (07.06.2023)
Course completion requirements - Czech
100% účast na výuce

Last update: Holanová Marcela (07.06.2023)
Teaching methods - Czech

Praktický kurz sestávající z teoretického úvodu a praktické laboratorní části v rozsahu 15 hodin

Last update: Holanová Marcela (07.06.2023)
Syllabus - Czech
  • Biomarkery
  • Dědičná metabolická onemocnění - modelový příklad: lysosomální střádavá onemocnění
  • Metody analýzy biomarkerů
  • Hmotnostní spektrometrie

Last update: Holanová Marcela (07.06.2023)
Education plan -
Schedule by date
Day Date Description Teacher Files Note Hodnocení
Monday10.11.202514:30-16:00 - teoretická část (minimální délka 2h) - přednáška by byla v čase 15-16 - v krajním případě by stačilo, abyste dorazili 10min. před přednáškou a v případě potřeby odešli v 16:00, kdybychom mírně přetahovali. Výuka bude probíhat na adrese Ke Karlovu 2 - areál KPDPM Pro přednášku je rezervována velká seminární místnost - budova E2, 1. patro - když vyjdete po schodišti do 1. patra, tak je mísnotst vlevo od schodiště RNDr. Ladislav Kuchař, Ph.D. 
průměr: 5, hodnoceno: 3x
Tuesday11.11.202513-16 - praktická příprava vzorků (zde je potřeba počítat s cca 3-4h) Vyřešíme administrativu jako je BOZP v laboratoři. RNDr. Ladislav Kuchař, Ph.D. 
průměr: 5, hodnoceno: 3x
Wednesday12.11.202513-16 - změření vzorků na hmotnostním spektrometru, jejich vyhodnocení a interpretace výsledků Na základě Vaší účasti provedu zápis zápočtu k získání kreditů do SISu.RNDr. Ladislav Kuchař, Ph.D. 
průměr: 5, hodnoceno: 1x