Molecular Immunology - MB150P15

• Title: Molekulární imunologie
• Guaranteed by: Department of Cell Biology (31-151)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2012 to 2013
• Semester: summer
• E-Credits: 3
• Examination process: summer s.:
• Hours per week, examination: summer s.:2/0, C [HT]
• Extent per academic year: 52 [hours]
• Capacity: 70
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: not taught
• Language: Czech
• Explanation: přednáška je situována do ÚMG, Vídeňská 1083, Praha 4-Modrá posluchárna přízemí/ pondělí 15,00 - 17,30 s přestávkou
• Additional information: http://mi.img.cas.cz/lab/ po zalogování: student/imuno
• Note: enabled for web enrollment
• Guarantor: RNDr. Karel Drbal, Ph.D.

Annotation

English

Last update: RNDr. Karel Drbal, Ph.D. (24.11.2011)

Please note, the lectures are given in czech language only.

The semestral lecture course focuses on substantial broadening of your knowledge about selected molecular mechanisms of immune system functioning that were covered within the previous basic course "Immunology" in the winter semester. It is strongly recommended to pass the basic lecture of Immunology first in the past semester plus the exam! We shall not discuss basic theory again.
Targeted to 3rd, 4th and 5th class and postgradual students.

The major emphasis is put on:
(1) molecular mechanisms of generation and function of immunoreceptors and MHC proteins, NK receptors, innate receptors, adhesion molecules, cytokines/chemokines and their respective receptors and other ligand/receptor pairs;
(2) coherent implication of essential signaling pathways and transcriptional programs to the functioning of immune cells;
(3) basic principles of current methods used in molecular immunology.

Czech

Last update: RNDr. Karel Drbal, Ph.D. (24.11.2011)

Přednáškový kurs je zaměřen na podstatné prohloubení znalostí o molekulárních mechanismech vybraných imunitních dějů, jejichž základy byly probrány v základní přednášce Imunologie.
Důrazně proto doporučuji dříve než se zapíšete na tuto přednášku, absolvovat v předchozím semestru základní přednašku Imunologie včetně zkoušky. Nebudeme opakovat základní imunologii!
Určeno pro studenty 3.,4. a 5. ročníku, příp. postgraduální.
Probírány budou následující témata a vztahy:
(1) molekulární mechanismy vzniku a funkce imunoreceptorů a MHC proteinů, NK receptorů, receptorů přirozené imunity, adhezivních molekul, cytokinů/chemokinů a jejich příslušných receptorů, další páry ligand/receptor
(2) důležité signalizační dráhy a transkripční programy a jejich širší souvislosti na buněčné úrovni
(3) základní principy současných metod používaných v molekulární imunologii

Literature

Last update: RNDr. Karel Drbal, Ph.D. (23.01.2012)

Obsah přednášky je POUZE ČÁSTEČNĚ pokryt v následujících knihách:

V. Hořejší, J. Bartůňková: Základy imunologie, 4. vydání, 316 str., Triton, Praha 2009 ISBN: 978-80-7387-280-9

(TATO KNIHA SLOUŽÍ JAKO ZÁKLADNÍ INFORMAČNÍ ZDROJ, KTERÝ MUSÍTE ZNÁT!)

C.A.Janeway, P.Travers, M.Walport, M.Slomchik: Immunobiology: The immune system in health and disease, 7th Edition, Garland Science Publishing 2008, 887 pages, ISBN: 0443073104

5. vydání je přístupné na NCBI: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=imm.TOC&depth=2

A. K. Abbas, A. H. Lichtman, S. Pillai: Cellular and Molecular Immunology, 6th Edition, Saunders 2007, 553 pages, ISBN: 1416031227

T. J. Kindt, R. A. Goldsby, B. A. Osborne, J. Kuby: Immunology, 6th Edition, W.H. Freeman, 2007 574 pages, ISBN: 0716785900

Requirements to the exam

Last update: RNDr. Karel Drbal, Ph.D. (20.02.2012)

Zkouška je hodnocena bodově a skládá se ze 3 oblastí (1 povinné, výběru ze 2 volitelných a 1 dobrovolné):

1/ POVINNÁ KOMPILACE (60 bodů): povinná kompilační práce na téma, které bylo v rámci přednášky pouze nakousnuto. Student má na výběr z >10 témat, která budou zveřejněna v polovině semestru. Každé vybrané téma poté student vypracuje samostatně, bude obodováno 0-40-ti body a společně pak dopilují skupiny studentů společné téma do stavu jejich zveřejnění na Wikipedii, preferenčně v anglickém jazyce (bodováno max. 20-ti body za kolektivní výkon).

2/ VOLITELNÝ TEST / PROJEKT (100 bodů): v povinné druhé části zkoušky mají studenti na výběr z klasického písemného testu nebo projektu (celkem max. 100 bodů):

• TEST se skládá z 20 krátkých otázek, na které lze odpovědět jednoslovně nebo jednovětně (0-3 body za každou otázku) a výběr 2 ze 4 komplexních témat zpracovaných vždy na 1 A4 stranu (2x 0-20 bodů). Celkově tedy může student získat až 100 bodů. Časově je písemný test omezen 2 hodinami čistého času.

• PROJEKT: <10 projektů je zadáno v polovině semestru a student vypracuje podrobný návrh obsahující využití poznatků molekulární imunologie v diagnostice lidských onemocnění. Projektům se budeme věnovat podrobně spolu s kompilacemi ve dvou termínech během druhé části letního semestru. Za projekt je možné obdržet 100 bodů stejně jako za písemný test.

Neuspěje-li student v této druhé části, bude prozkoušen ústně v druhém termínu.

3/ DOBROVOLNÉ NEPOVINNÉ TESTY = OPAKOVÁNÍ (40 bodů): mezi hodinami bude vyvěšena anketa kontrolních otázek sumarizujících předchozí hodinu na síť a student zde může získat až 10x 4 bodů za správné odpovědi. Společně na úvod další hodiny probereme správně odpovědi.

Celkový možný bodový součet za zkoušku je 200 bodů, na 1 je třeba 160, na 2 alespoň 120, na 3 minimálně 80 bodů.

Syllabus

English

Last update: RNDr. Karel Drbal, Ph.D. (24.11.2011)

LECTURES
1. Receptors of innate immune cells recognizing pathogens in our bodies = PAMP, DAMP, danger theory

2. Toll like receptors, NOD like receptors, inflammasome

3. Receptors of NK cells, NKT cells

4. MHC proteins function, classical and non-classical

5. Diversity of TCR and BCR

6. Mechanisms of signaling via immunoreceptors

7. Activation of T cells - the role of costimulatory receptors

8. Cytokines, chemokines - their receptors and signaling

9. Adhesion molecules, Fc receptors and complement receptors

10.Signaling networks and protein interaction domains

Additional topics:

• Characteristic markers of leukocyte subpopulations

• Principles of some relevant methods in immunochemistry, molecular biology and biochemistry

The lecture is available in presentation slides, which summarize the discussed topics. The presence at the lectures is essential for full understanding. Winter course "Immunology" plus passing the exam during winter semester is a prerequisite for participation in this course.

Czech

Last update: RNDr. Karel Drbal, Ph.D. (24.11.2011)

PŘEDNÁŠKY
1. Receptory přirozené imunity rozeznávají vetřelce v našich tělech = PAMP, DAMP, teorie nebezpečí

2. Toll like receptory, NOD like receptory, inflamazom

3. Receptory NK buněk, NKT buněk

4. Funkce MHC proteinů, klasické a neklasické

5. Diverzita TCR a BCR

6. Mechanismy signalizace přes imunoreceptory

7. Aktivace T lymfocytů - role kostimulačních receptorů

8. Cytokiny, chemokiny - jejich receptory a signalizace

9. Adhezivní molekuly, Fc receptory a komplementové receptory

10.Signalizační sítě a interakční domény proteinů

Další témata:

Charakteristické molekuly leukocytárních subpopulací

Principy základních imunologických, molekulárně biologických a biochemických metod

Přednáška je shrnuta v dostupné prezentaci, ovšem je jen připomenutím faktů o kterých se v přednášce mluví. Pro úplné pochopení látky je nutná přítomnost na přednáškách. Samozřejmým předpokladem je znalost základů, tedy toho, co se probíralo v základní přednášce "Imunologie" v zimním semestru.