Practical courses of bacterial physiology - MB140C34

• Title: Praktikum z fyziologie bakterií
• Guaranteed by: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2012 to 2013
• Semester: winter
• E-Credits: 3
• Examination process: winter s.:
• Hours per week, examination: winter s.:0/1, C [TS]
• Extent per academic year: 1 [weeks]
• Capacity: 20
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Level: basic
• Explanation: jednotýdenní turnusové praktikum (celkem 2 turnusy po 10 lidech),termín bude určen v průběhu semestru, zápis do turnusů proběhne přes SIS
• Note: enabled for web enrollment
• Guarantor: RNDr. Jana Beranová, Ph.D.
• Teacher(s): RNDr. Jana Beranová, Ph.D.; doc. RNDr. Radovan Fišer, Ph.D.
• Attributes: Modul Fyziologie a anatomie / morfologie
• Co-requisite : MB140P34

Annotation

English

The laboratory course consists of the spectrum of basic and  advanced  methods used in physiology of bacteria  to
characterize  bacterial growth, metabolic variability and regulation of gene expression in response to the environmental
condition. Students will learn how to work with pathogenic bacteria producing virulence factors. The course is held in Czech.

Last update: Beranová Jana, RNDr., Ph.D. (20.08.2014)

Czech

Kurz je volitelným rozšířením předmětu Fyziologie bakterií. Cílem praktika je seznámit se se spektrem metod základních i pokročilých, umožňujících sledovat profilové fyziologické vlastnosti bakterií, tj. růst, rozmanitost energetického metabolizmu a regulaci genové exprese v závislosti na podmínkách vnějšího prostředí. Studenti se naučí zacházet s kulturou patogenních bakterií u kterých budou sledovat produkci faktorů virulence. Kurz je veden v českém jazyce.

Last update: Beranová Jana, RNDr., Ph.D. (20.08.2014)

Literature

English

Mikrobiologické praktikum, František Kaprálek, 1999, Karolinum

Practical course manuals (updated version will be available in advance, before the course start). (in Czech language)

Last update: Beranová Jana, RNDr., Ph.D. (03.10.2012)

Czech

Mikrobiologické praktikum, František Kaprálek, 1999, Karolinum

Návody k úlohám (aktuální verze, v elektronické podobě, budou k dispozici v předstihu před zahájením praktika).

Last update: Beranová Jana, RNDr., Ph.D. (20.08.2014)

Requirements to the exam

English

To obtain credits for this course, the requirements are following: 100% presence during the course run, correctly elaborated protocols (electronic version, handover in the last day of the course run).

Last update: Beranová Jana, RNDr., Ph.D. (05.04.2012)

Czech

Zápočet bude udělen v případě 100% docházky do praktika a odevzdání správně vypracovaných protokolů (výhradně v předepsané elektronické verzi). Protokoly se odevzdávají v poslední den kurzu.

Last update: Beranová Jana, RNDr., Ph.D. (03.10.2012)

Syllabus

English

Within the one week course four experiments will be performed:

1. Growth yield and metabolic rate measurement in growing bacterial culture; effect of energy metabolism type on growth rate, growth yield and metabolic rate of bacterial culture.

2. Induction of enzyme synthesis in growing bacteria and catabolic repression.

3. Oxygen-dissolving rate measurement in cultivation medium.

4. Modulation of Bvg+ virulent phase of bacterium Bordetella

Last update: Beranová Jana, RNDr., Ph.D. (20.08.2014)

Czech

V programu týdenního praktika budou provedeny čtyři úlohy:

1. Růstový výtěžek a metabolická rychlost u rostoucí kultury bakterií; vliv typu energetického metabolizmu na růstovou rychlost, růstový výtěžek a metabolickou rychlost bakterií.

2. Indukce syntézy enzymu u rostoucích bakterií a katabolická represe.

3. Stanovení rychlosti rozpouštění kyslíku v živném médiu.

4. Modulace viruletní fáze Bvg+ u bakterie Bordetella

Last update: Beranová Jana, RNDr., Ph.D. (20.08.2014)

Entry requirements

Kurz je rozšířením předmětu Fyziologie bakterií (MB140P34; korekvizita), nicméně není k této přednášce povinný. Je určen pro studenty se zájmem o mikrobiologii. Podmínkou je dřívejší absolvování předmětu Mikrobiologie MB140P33I! Kapacita předmětu je 20 osob a nemůže být z technických důvodů navýšena.

Pro účast v praktiku je podmínkou složení vstupního testu - termín bude s předstihem oznámen.

Protokoly se odevzdávají v elektronické podobě ve formátech *.doc, *.odt nebo *rtf. Předpokládá se tedy nejméně slušná uživatelská znalost příslušného textového editoru. Rovněž je nutná znalost tvorby grafů (MS Excel, OpenOffice). Některými daty se prokládá přímka pomocí funkce lineární regrese. K tomu lze použít následující programy: MS Excel, Gnumeric, Origin, Qtiplot, Fityk, Gnuplot nebo R (OpenOffice nemusí vyhovět).

Odkazy na dostupný software: http://projects.gnome.org/gnumeric/, http://soft.proindependent.com/qtiplot.html, http://fityk.nieto.pl/, http://www.gnuplot.info/, http://www.r-project.org/

Během praktika lze s výhodou používat vlastní notebook pro průběžné zpracování dat. (Vlastní notebook není podmínkou. Studenti bez vlastní výpočetní techniky mohou protokoly zpracovávat v počítačových účebnách PřF.)

Last update: Beranová Jana, RNDr., Ph.D. (20.08.2014)