Plant cell and molecular biology - a practical course - MB130C34

• Title: Praktikum z buněčné a molekulární biologie rostlin
• Guaranteed by: Department of Experimental Plant Biology (31-130)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2012 to 2012
• Semester: summer
• E-Credits: 2
• Examination process: summer s.:
• Hours per week, examination: summer s.:0/1, C [TS]
• Extent per academic year: 1 [weeks]
• Capacity: unlimited
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Additional information: http://kfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/molprakt/index.html
• Guarantor: prof. RNDr. Viktor Žárský, CSc.

Annotation

English

Last update: RNDr. Hana Konrádová, Ph.D. (18.03.2019)

The course includes practical examples and theoretical background of a selection of modern methods of plant cell and molecular biology, in particular the techniques employed to study gene expression in plant material, transient expression of introduced genes in plant cells and protoplasts, and construction and analysis of transgenic plants.
The course is intended mainly for Masters and PhD students whose experimental interests include some of the methods taught.

Czech

Last update: RNDr. Hana Konrádová, Ph.D. (18.03.2019)

Cílem kursu je prakticky i teoreticky seznámit studenty s vybranými moderními metodami buněčné a molekulární biologie rostlin, zejména s metodami studia genové exprese v rostlinném materiálu, transientní expresí vnesených genů v rostlinných buňkách a protoplastech a přípravou a analýzou transgenních rostlin.
Kurs je určen zejména posluchačům magisterského stupně studia a doktorandům, kteří hodlají některé z okruhu probíraných metodických přístupů využívat v experimentální práci.

Literature

Last update: RNDr. Hana Konrádová, Ph.D. (18.03.2019)

http://kfrserver.natur.cuni.cz/cz/edu/molprakt/

Syllabus

English

Last update: RNDr. Hana Konrádová, Ph.D. (18.03.2019)

Practical tasks :

1. Detection of the cytoskeleton in cultured plant cells (immunofluorescence microscopy, Western blot)

2. Expression and affinity purification of a bacterially expressed plant protein.

3. Transient expression of a GFP-tagged protein using the tobacco leaf infiltration method.

4. Transient expression of a gene introduced into tobacco protoplasts (and detection of a GFP-tagged gene product).

5. Arabidopsis transformation (in situ infiltration by Agrobacterium, transgene selection).

6. Detection of inducible gene expression in plant cells using the reporter gene approach.

7. Transgenic plant detection using PCR.

8. In silico cloning and mutagenesis - introduction into basic bioinformatic tools.

Czech

Last update: RNDr. Hana Konrádová, Ph.D. (18.03.2019)

Úlohy řešené v praktiku :

1. Detekce cytoskeletu v rostlinných buňkách (imunofluorescenční mikroskopie, Western blot)

2. Exprese a afinitní purifikace rostlinného rekombinantního proteinu v bakteriích.

3. Transientní exprese bílkoviny značené GFP po infiltraci listů tabáku.

4. Transientní exprese vneseného genu v tabákových protoplastech (detekce exprese s využitím GFP značky).

5. Transformace Arabidopsis (in situ infiltrace květenství suspenzí Agrobacteria, selekce transgenních rostlin).

6. Detekce indukce genové exprese v rostlinných buňkách (reporterový gen pod regulovaným promotorem).

7. Detekce transgenu v rostlinách (izolace DNA, PCR, detekce produktů).

8. Klonování a mutageneze in silico (seznámení se základními bioinformatickými nástroji).