Thesis (Selection of subject)Thesis (Selection of subject)(version: 368)
Thesis details
   Login via CAS
Role of the human DDI2 protein in gene expression regulation
Thesis title in Czech: Role lidského DDI2 proteinu v regulaci genové exprese
Thesis title in English: Role of the human DDI2 protein in gene expression regulation
Key words: DNA damage-inducible protein, proteasa, inhibice, regulace genové exprese
English key words: DNA damage-inducible protein, protease, inhibition, gene expression regulation
Academic year of topic announcement: 2018/2019
Thesis type: dissertation
Thesis language: angličtina
Department: Faculty of Science (11-00014)
Supervisor: Mgr. Klára Grantz Šašková, Ph.D.
Author: hidden - assigned by the advisor
Date of registration: 17.10.2018
Date of assignment: 17.10.2018
Preliminary scope of work
Náplní navrhované disertační práce bude studium vlivu inhibice DDI2 proteasy za současné inhibice proteasomu na aktivační kaskádu transkripčního faktoru Nrf1(NFE2L1) odpovědného za resyntézu proteasomu. Toto bude sledováno primárně v lidských myelomových buněčných liniích, případně v dalších rakovinných buněčných liniích. Pomocí vitalitní buněčné eseje bude otestována řada malých molekul ovlivňujících tuto dráhu. Ty budou dále validovány na inhibici DDI2 proteasy, případně bude hledán jiný buněčný cíl afektovaný danou látku s vysokým inhibičním účinkem na růst dané buněčné linie. Látky s nejzajímavějším účinkem budou dále biochemicky charakterizovány. Další součástí práce bude zkoumání vzniku resistence k proteasomovým inhibitorům při léčbě mnohočetného myelomu. Jedním z cílů bude zhodnotit vliv Nrf1 signální dráhy (tj. míra exprese a akumulace mutací jednotlivých složek dráhy) na rozvoj rezistence proti proteasomovým inhibitorům a následně tak zhodnotit efekt samotné léčby těmito inhibitory. V neposlední řadě se práce bude věnovat vlivu inhibitorů proteasomu na myší jaterní C5751/6N-Ddi2 (em1/Rase) knock-out kmen.
Preliminary scope of work in English
Proposed doctoral project will be focusing on the outcome of DDI2 protease and simultaneous proteasome inhibition on Nrf1-dependent proteasome synthesis. This will be primarily monitored in human myeloma cells, eventually in other cancer cell lines. We will test various small molecule compounds affecting Nrf1 pathway, some of those will be further validated on DDI2 protein inhibition, eventually their protein targets will be searched. The most promissing compounds will be further biochemically characterized. Furthemore, we will focus on the resistance development in multiple myeloma treated with proteasome inhibitors such as bortezomib or carfilzomib. We will analyze Nrf1 pathway in resistance development and thus evaluate the effect of proteasome inhibition on the overall outcome of the therapy. Last but not least we will test the effect of proteasome inhibition on the mouse liver knock-out (C5751/6N-Ddi2 (em1/Rase)) developed in our laboratory.
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html