|
  Thesis title |
Year of announcement |
Year of defence |
Thesis type |
Thesis discipline | Supervisor |
Author |
Announced |
Assigned | Department |
Faculty |
 |
Graph-based molecular representation and its utilization in virtual screening |
2016/2017 |
2016/2017 |
Bachelor's thesis |
IOI | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
13.03.2017 |
15.03.2017 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
A framework for visual analysis of protein structure states |
2022/2023 |
2022/2023 |
diploma thesis |
ISDP | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
12.10.2022 |
13.10.2022 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
RNA secondary structure visualization using existing structures |
2014/2015 |
2015/2016 |
Bachelor's thesis |
IOI | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
Mgr. Richard Eliáš |
26.09.2014 |
26.09.2014 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Artificial intelligence module – Expert system for differential and predictive diagnostics |
2013/2014 |
|
diploma thesis |
| doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
11.12.2013 |
11.12.2013 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Machine learning-based identification of separating features in molecular fragments |
2015/2016 |
2016/2017 |
Bachelor's thesis |
IOIA | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
06.11.2015 |
27.11.2015 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Web-based plugin for combined sequence and structure analysis of proteins |
2020/2021 |
2020/2021 |
Bachelor's thesis |
IOI | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
Bc. Veronika Scheuerová |
08.04.2021 |
12.04.2021 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Utiliziation of uncorrelated multi-point pharmacophores in virtual screening |
2015/2016 |
2015/2016 |
Bachelor's thesis |
IOI | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
06.11.2015 |
10.11.2015 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Utilization of latent semantic analysis in virtual screening |
2015/2016 |
2016/2017 |
Bachelor's thesis |
IOI | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
18.04.2016 |
21.04.2016 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Protein secondary structure prediction using deep neural networks |
2016/2017 |
2016/2017 |
diploma thesis |
IUI | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
15.03.2017 |
15.03.2017 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Multiple RNA Structure Similarity |
2011/2012 |
2012/2013 |
diploma thesis |
ISS | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
02.06.2011 |
20.10.2011 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Detection of protein-ligand binding sites using 3D Vision Transformers |
2022/2023 |
2022/2023 |
Bachelor's thesis |
IPP5 | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
Bc. Ondrej Lopuch |
10.01.2023 |
10.01.2023 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Protein Structure Similarity Using Genetic Programming |
2010/2011 |
2012/2013 |
Bachelor's thesis |
IP | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
09.05.2010 |
09.05.2010 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Internal IS for travel agency |
2007/2008 |
2008/2009 |
Bachelor's thesis |
ISPS | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
05.10.2007 |
05.10.2007 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Algorithmic prediction of protein-protein interactions |
2013/2014 |
|
dissertation |
4I2 | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
28.04.2014 |
26.09.2014 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Using convolutional neural networks to detect protein-ligand binding sites |
2023/2024 |
2024/2025 |
Bachelor's thesis |
| doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
22.02.2024 |
23.02.2024 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
DEBRA - Derscriptor Barn |
2012/2013 |
2012/2013 |
Bachelor's thesis |
IOI | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
18.03.2013 |
18.03.2013 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Data Generator for Microsoft SQL Server |
2012/2013 |
2012/2013 |
Bachelor's thesis |
IOI | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
17.10.2012 |
31.10.2012 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Representation of chemical compounds and its utilization in similarity search |
2013/2014 |
2018/2019 |
dissertation |
4I2 | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
Mgr. Petr Škoda, Ph.D. |
23.04.2014 |
26.09.2014 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Using combined sequence and structural features to predict protein-ligand binding sites |
2023/2024 |
2023/2024 |
diploma thesis |
| doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
22.01.2024 |
26.01.2024 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Configurable point rasterization for large scatterplots |
2021/2022 |
2022/2023 |
Bachelor's thesis |
IPP6 | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
06.11.2021 |
08.11.2021 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Structure-based detection of protein interaction sites with machine learning |
2022/2023 |
|
dissertation |
P4I2A | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
17.05.2022 |
19.09.2022 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Generation of protein sequences with a given characteristic |
2023/2024 |
2023/2024 |
Bachelor's thesis |
| doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
Bc. Hugo Hrbáň |
12.04.2024 |
12.04.2024 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Visualisation of secondary structure of RNA molecules |
2011/2012 |
2012/2013 |
Bachelor's thesis |
IOI | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
31.07.2012 |
31.07.2012 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Visual Graph Tool |
2006/2007 |
|
Bachelor's thesis |
IP | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
08.11.2006 |
17.01.2007 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Efficient molecular representation design |
2013/2014 |
2013/2014 |
diploma thesis |
ISS | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
05.11.2013 |
06.11.2013 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Extension of web-based interface for protein binding sites prediction |
2022/2023 |
2022/2023 |
Bachelor's thesis |
IPP2 | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
Bc. Lukáš Polák |
27.10.2022 |
27.10.2022 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Using tree edit distance to model structural similarity of RNA molecules |
2016/2017 |
2016/2017 |
diploma thesis |
IUI | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
07.06.2016 |
30.01.2017 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
WESNA - program for creation html presentations with php components |
2009/2010 |
2009/2010 |
Bachelor's thesis |
| doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
21.10.2009 |
02.11.2009 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Groupeas |
2009/2010 |
2009/2010 |
Bachelor's thesis |
| doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
28.10.2009 |
06.11.2009 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Structure-based detection of protein interaction sites with machine learning |
2023/2024 |
|
dissertation |
P4I6A | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
21.02.2024 |
20.03.2024 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Atomix for Microsoft Kinect for Windows |
2012/2013 |
2013/2014 |
diploma thesis |
ISS | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
13.08.2012 |
19.03.2013 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Algorithm for true positives identification of protein-ligand complexes |
2012/2013 |
|
diploma thesis |
| doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
05.03.2013 |
05.03.2013 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Prediction and visualization of cryptic binding regions |
2024/2025 |
|
diploma thesis |
| doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
03.04.2025 |
03.04.2025 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Biobank |
2012/2013 |
2012/2013 |
Bachelor's thesis |
IOI | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
21.02.2013 |
21.02.2013 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
RNA tertiary structure prediction using multiple templates |
2018/2019 |
2018/2019 |
diploma thesis |
IUI | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
08.02.2019 |
12.02.2019 | Katedra teoretické informatiky a matematické logiky (32-KTIML) |
MFF |
|
Application for monitoring and analysis of vascular reconstructions |
2015/2016 |
2016/2017 |
rigorosum thesis |
ISS | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
23.08.2016 |
23.08.2016 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Template-based RNA tertiary structure prediction |
2015/2016 |
2015/2016 |
Bachelor's thesis |
ISDI | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
16.11.2015 |
17.11.2015 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Web plugin for multiple RNA secondary structure visualization |
2022/2023 |
2022/2023 |
Bachelor's thesis |
IPP2 | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
Bc. Michal Hercík |
12.10.2022 |
13.10.2022 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Detection of protein-ligand binding sites using graph neural networks |
2021/2022 |
2021/2022 |
diploma thesis |
| doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
13.10.2021 |
19.10.2021 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Web-based tool for RNA secondary structure visualization |
2017/2018 |
2017/2018 |
Bachelor's thesis |
| doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
08.10.2017 |
08.10.2017 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Importing simple-structured data into DB |
2010/2011 |
|
Bachelor's thesis |
| doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
12.05.2007 |
29.11.2010 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Munis Instant |
2010/2011 |
2010/2011 |
Bachelor's thesis |
| doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
13.01.2011 |
13.01.2011 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Internal IS for travel agency |
2007/2008 |
2009/2010 |
Bachelor's thesis |
ISPS | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
05.10.2007 |
05.10.2007 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Database prediction of small molecules side effects |
2014/2015 |
|
diploma thesis |
| doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
29.09.2014 |
29.09.2014 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
IS for organizaton's production monitoring |
2010/2011 |
2010/2011 |
Bachelor's thesis |
| doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
10.11.2010 |
10.11.2010 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Hierarchical visualization of the chemical space |
2014/2015 |
2015/2016 |
diploma thesis |
| doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
14.04.2015 |
22.09.2015 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Oracle Visual Tools |
2008/2009 |
2009/2010 |
Bachelor's thesis |
IOI | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
11.02.2009 |
03.08.2009 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Scaffold hopping-based exploration of chemical space |
2012/2013 |
2013/2014 |
diploma thesis |
ISS | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
31.10.2012 |
31.10.2012 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Visual Querying in Chemical Databases using SMARTS Patterns |
2012/2013 |
2013/2014 |
Bachelor's thesis |
IP | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
07.12.2011 |
17.02.2013 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
|
Database of students and their payments |
2007/2008 |
2008/2009 |
Bachelor's thesis |
IOI | doc. RNDr. David Hoksza, Ph.D. |
hidden |
08.10.2007 |
05.05.2008 | Katedra softwarového inženýrství (32-KSI) |
MFF |
Results 1-50 of 65 1 2 next
|
