Analýza biosenzorických dat
| Thesis title in thesis language (Slovak): | Analýza biosenzorických dat |
|---|---|
| Thesis title in Czech: | Analýza biosenzorických dat |
| Thesis title in English: | Analysis of Biosensoric Data |
| Academic year of topic announcement: | 2005/2006 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | slovenština |
| Department: | Department of Probability and Mathematical Statistics (32-KPMS) |
| Supervisor: | doc. RNDr. Zdeněk Hlávka, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 06.10.2005 |
| Date of assignment: | 06.10.2005 |
| Date and time of defence: | 15.05.2007 00:00 |
| Date of electronic submission: | 15.05.2007 |
| Date of submission of printed version: | 06.10.2005 |
| Date of proceeded defence: | 15.05.2007 |
| Opponents: | prof. RNDr. Jaromír Antoch, CSc. |
| Guidelines |
| Pseudomonas fluorescens HK44 je geneticky modifikovaný mikroorganismus, nesoucí umělý
plazmid pUTK21, na kterém jsou umístěny geny kódující horní a spodní degradační dráhu naftalenu. Do těchto drah byla vložena sada genů luxCDABE z bakterie Vibrio fischeri. Bakterie nesoucí plazmid pUTK21 emituje luminiscenci po indukci naftalenem resp. jeho metabolickým meziproduktem salicylátem. Diplomant bude analyzovat data o relativní luminiscenci těchto geneticky modifikovaných bakterií v závislosti na přítomnosti a koncentraci testovaných látek pomocí modelu s náhodnými efekty a pomocí lineárního hierarchického modelu. Cílem práce je především porovnání výsledků této analýzy s výsledky dosaženými v Trögl (2005). Ve druhé části diplomové práce se diplomant pokusí o vyšetření závislosti luminiscence bakterií na struktuře testovaných látek. Výsledky této diplomové práce budou použity při konstrukci biosenzorů. Data o luminiscenci poskytne Ústav chemických procesů AV ČR. |
| References |
| Gelman, A., Carlin, J.B., Stern, H.S., and Rubin, D.B. (2004). Bayesian Data Analysis, Chapman and Hall/CRC, Boca Raton.
Kuchař, M. and Rejholec, V. (1980). Kvantitativní vztahy mezi strukturou a biologickou aktivitou, Studie ČSAV 3/1980, Academia, Praha. Pinheiro, J.C. and Bates, D.M. (2000). Mixed-Effects Models in S and S-Plus, Springer, New York. Trögl, J. (2005). Vývoj biosenzoru pro stanovení polutantů v životním prostředí, disertační práce, VŠCHT Praha. |