Studium interakcí porfyrinů s jednovláknovými úseky DNA
| Thesis title in Czech: | Studium interakcí porfyrinů s jednovláknovými úseky DNA |
|---|---|
| Thesis title in English: | |
| Academic year of topic announcement: | 2006/2007 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | |
| Department: | Department of Low Temperature Physics (32-KFNT) |
| Supervisor: | prof. RNDr. Helena Štěpánková, CSc. |
| Author: |
| Guidelines |
| Pracovní úkoly:
1. Seznámit se s principy metody nukleární magnetické rezonance (NMR). 2. Osvojit si základy obsluhy spektrometru NMR vysokého rozlišení. 3. Seznámit se s jevem paramagnetického zkracování relaxačních dob NMR. 4. Udělat přehled literárních údajů o dosavadních znalostech o specificitě vazby porfyrinů na řetězce DNA. 5. Navrhnout bázové složení testovacího řetězce (řetězců) DNA. 6. Proměřit NMR spektra a relaxační doby řetězců DNA ve vodném roztoku za několika teplot a sledovat případné změny vyvolané přítomností měďnatého kationického porfyrinu. |
| Preliminary scope of work |
| Porfyriny jsou přirozené biomolekuly, které nacházejí použití i v souvislosti s terapií založenou na syntetických řetězcích nukleových kyselin. Bylo zjištěno, že kationické deriváty porfyrinů se mohou vázat na jednovláknové úseky DNA takovým způsobem, že podstatně usnadňují vstup těchto molekul do buněk. Zatím je však známo velmi málo detailů nejen o geometrii této vazby, ale i o optimálním bázovém složení vazebného místa. Pokud se při experimentech pracuje s metaloporfyriny, které mají zabudován paramagnetický iont vhodného kovu (například mědi), lze očekávat, že metoda jaderné magnetické rezonance (NMR) umožní velmi citlivě zjišťovat lokalizaci tohoto iontu.
|