Studium interakcí časných proteinů polyomavirů s buněčnými proteiny

• Thesis title in Czech: Studium interakcí časných proteinů polyomavirů s buněčnými proteiny
• Thesis title in English: Study of interactions of polyomavirus early proteins with cellular proteins
• Key words: polyomavirus, časný protein, velký T antigen, proteinová interakce, replikace viru
• English key words: polyomavirus, early protein, large T antigen, protein interaction, virus replication
• Academic year of topic announcement: 2024/2025
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
• Supervisor: Mgr. Vojtěch Šroller, Ph.D.
• Author: hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
• Date of registration: 25.11.2024
• Date of assignment: 25.11.2024
• Confirmed by Study dept. on: 03.12.2024
• Study form: full-time

Preliminary scope of work

Po vstupu polyomaviru do buňky dochází nejprve k produkci virových časných proteinů.
Jedná se o malý a velký nádorový antigen (small and large tumour antigen, ST and LT),
u některých polyomavirů i střední antigen (middle T, MT).
Časné virové proteiny jsou multifunkční proteiny, které se podílejí na regulaci virové replikace a některých buněčných drah.
Ko-imunoprecipitací a hmotnostní spektrometrií jsme získali soubor buněčných proteinů, které
interagují s LT antigenem myšího polyomaviru.
Náplní diplomové práce bude ověřit některé z těchto interakcí mezi LT a buněčnými proteiny.
Jedná se například o buněčný protein Baf57, který je součástí komplexu remodelujícího chromatin.
Pro ověření interakce budou použity metody imunofluorescenčního barvení, konfokální mikroskopie a imunodetekce.
Vliv této interakce na virový infekční cyklys bude sledován s použitím buněk, kde je exprese proteinu Baf57 snížena nebo
potlačena. Průběh virového infekčního cyklu bude sledován metodami imunoflurescence a qPCR.