Mechanismy předcházení a vzniku chromozomálních přestaveb
| Thesis title in Czech: | Mechanismy předcházení a vzniku chromozomálních přestaveb |
|---|---|
| Thesis title in English: | Mechanisms of prevention and formation of chromosomal rearrangements |
| Key words: | Stabilita genomů, evoluce genomů, opravy zlomů DNA, homologní rekombinace, heterochromatin, metylace DNA, inverze, delece, translokace, duplikace, ztráty |
| English key words: | Genome stability, genome evolution, DNA repair, homologous recombination, heterochromatin, DNA methylation, inversion, deletion, translocation, duplication, loss |
| Academic year of topic announcement: | 2024/2025 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | |
| Department: | Department of Experimental Plant Biology (31-130) |
| Supervisor: | RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D. |
| Author: | |
| Advisors: | Mgr. Adéla Přibylová, Ph.D. |
| Preliminary scope of work |
| Evoluce organismů je umožněna změnami jejich genetické informace a následným působením různých selekčních tlaků. Genetická informace je uložena ve formě chromozomů - dlouhých úseků DNA, v nichž jsou lineárně uspořádané geny promísené s velkým množstvím nekódující DNA různého původu a funkce. Evoluční proměny pohání víceméně náhodné změny genetické informace, a to jak na úrovni „bodové“ (drobné změny jednotlivých genů), tak na úrovni přestaveb chromozomů a celých genomů. Tyto změny jsou mj. důležité např. v procesu speciace (vzniku druhů). Přestavby jsou často důsledkem zlomů DNA a jejich nedokonalou opravou. Opravy zlomů DNA mají velmi nízkou chybovost, aby byla zajištěna stabilita genomů (a tím vzájemnou podobnost genomů jedinců daného druhu, jež je nezbytná pro generativní rozmnožování - tvorbu gamet). Úplná bezchybnost opravných procesů by ale vedla k zamrznutí evoluce. Náplní bakalářské práce je shrnout dostupné literární údaje o mechanismech vzniku strukturních přestaveb chromozomů - inverzí, delecí, translokací, duplikací a ztrát částí chromozomů a mechanismů, jak se těmto procesům buňky brání (primárně by měla být práce zaměřena na rostliny, ale zdrojem informací o obecných mechanismech mohou být i další modely – např. rakovinné buňky, kde jsou chromozomální přestavby častým jevem). Na bakalářskou práci bude navazovat práce diplomová, zaměřená především bioinformaticky na analýzy chromozomových přestaveb v buněčných liniích tabáku a zjišťování jejich možných příčin. |