Studium dynamických procesů v oxoporfyrinogenech
| Thesis title in Czech: | Studium dynamických procesů v oxoporfyrinogenech |
|---|---|
| Thesis title in English: | Study of dynamic processes in oxoporphyrinogens |
| Key words: | oxoporfyrinogeny|dynamické procesy|spektroskopie NMR|chemická výměna |
| English key words: | oxoporphyrinogens|dynamic processes|NMR spectroscopy|chemical exchange |
| Academic year of topic announcement: | 2023/2024 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | |
| Department: | Department of Macromolecular Physics (32-KMF) |
| Supervisor: | Mgr. Václav Březina, Ph.D. |
| Author: |
| Guidelines |
| Seznámení se spektroskopií NMR a obsluhou spektrometru
Studium literatury z oblasti oxoporfyrinogenů a dynamických procesů v molekulárních systémech Příprava vzorků a měření spekter NMR Zpracování a interpretace naměřených dat Sepsání diplomové práce |
| References |
| [1] M. Levitt „Spin Dynamics: Basics of Nuclear Magnetic Resonance“, John Wiley & Sons, 2001.
[2] J. Labuta, Z. Futera, S. Ishihara, H. Kouřilová, Y. Tateyama, K. Ariga and J. P. Hill. „Chiral Guest Binding as a Probe of Macrocycle Dynamics and Tautomerism in a Conjugated Tetrapyrrole”, JACS 136, 5 (2014): 2112–18. [3] V. Březina, L. Hanyková, N. Velychkivska, J. P. Hill, and Jan Labuta. „NMR Lineshape Analysis Using Analytical Solutions of Multi-State Chemical Exchange with Applications to Kinetics of Host–Guest Systems”, Scientific Reports 12, 1 (2022): 17369. [4] V. Březina „Supramolecular Complexes of Oxoporphyrinogens with Organic Molecules”, dizertační práce (2022). [5] K. A. Connors „Chemical Kinetics: The Study of Reaction Rates in Solution“, Wiley, 1990. |
| Preliminary scope of work |
| Oxoporfyrinogeny jsou molekuly obsahující tetrapyrrolový makrocyklus podobně jako chlorofyl, vitamín B12, hem a další důležité biomolekuly. Tato struktura umožňuje vznik stabilního komplexu s některými organickými sloučeninami a následně široké využití při detekci těchto sloučenin v roztoku. Oxoporfyrinogeny interagují i s organickými kyselinami, kde kromě vzniku komplexu navíc dochází k protonaci oxoporfyrinogenu, což pak umožňuje průběh různých dynamických dějů. Tyto děje a jejich rychlost lze zkoumat pomocí spektroskopie nukleární magnetické rezonance (NMR) díky tzv. chemické výměně. Dosavadní výsledky ukazují neobvyklé teplotní a koncentrační závislosti příslušných rychlostních koeficientů, což otevírá možnost pro další výzkum.
Cílem této práce je studium dynamiky vybraného systému oxoporfyrinogen + kyselina pomocí spektroskopie NMR. Budou zkoumány dynamické děje při různých teplotách a koncentracích. |