Charakterizace nového organizátoru v embryonálním vývoji
| Thesis title in Czech: | Charakterizace nového organizátoru v embryonálním vývoji |
|---|---|
| Thesis title in English: | Characterization of novel organizer in embryonic development |
| Key words: | organizátor, vnější žábra, axolotl, vývoj, osové určení |
| English key words: | organizer, external gill, axolotl, development, axial specification |
| Academic year of topic announcement: | 2022/2023 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Cell Biology (31-151) |
| Supervisor: | Mgr. Vladimír Soukup, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 19.10.2022 |
| Date of assignment: | 25.10.2022 |
| Confirmed by Study dept. on: | 27.01.2023 |
| Preliminary scope of work |
| Organizátory jsou specializované oblasti embrya, které indukují a řídí výslednou podobu okolních tkání. K příkladům patří dorzální ret blastoporu (organizátor Spemanna-Mangoldové), hranice mezi středním a zadním mozkem nebo apikální ektodermální hřeben (AER) a zóna polarizující aktivity (ZPA) končetiny. Vzhledem k jejich významu pro vývoj embryonálního těla se však počet organizátorů zdá být překvapivě nízký. Cílem předkládaného projektu je popsat zcela nový organizátor embryonálního těla, který řídí vývoj vnějších žaber obojživelníků. Vnější žábry jsou klíčovou tělní extremitou larválních forem těch živočichů, jejichž fylogenetická pozice a ekologie je spojena s přechodem na souš, tedy zásadní události v evoluci obratlovců. Podle předběžných výsledků usuzujeme, že vyrůstání a osové určení této tělní extremity je řízeno doposud neidentifikovaným organizačním centrem podobným končetinovému AER. Předkládaný projekt bude řešen pomocí histologických (hematoxylin/eosin, plastová histologie), imunofluorescenčních, expresních (in situ hybridizace) a funkčních (gain-of-function a loss-of-function farmakologie) přístupů. Tento projekt má, po důkladné analýze morfologických, molekulárních a funkčních charakteristik, potenciál identifikovat nový organizátor vývoje tělních extremit a embryogeneze jako takové. |
| Preliminary scope of work in English |
| Organizers are specialized regions of the embryo that induce and pattern adjacent tissues. Among them are e.g. the dorsal lip of blastopore (Spemann-Mangold organizer), the midbrain-hindbrain boundary, or the apical ectodermal ridge (AER) plus the zone of polarizing activity of the limb bud. Despite their importance to pattern the complex embryo, the number of known organizers is surprisingly low. In this proposed project, we aim to characterize a novel yet-unidentified organizer of the embryonic body, namely that of the amphibian external gill. This structure is a crucial body appendage of larval forms of animals that are phylogenetically and ecologically placed at the water-to-land transition, a hallmark event in the vertebrate evolution. Based on our preliminary data, we reason that the outgrowth and axial patterning of this appendage is regulated by an organizing center, possibly related to the AER. This project will utilize histological (hematoxylin/eosin, plastic rezin histology), immunofluorescent, gene expression (in situ hybridization) and functional (gain-of-function and loss-of-function pharmacology) approaches. Upon thorough morphological, molecular and functional characterization, this project has the potential to identify novel organizer of vertebrate embryonic development. |