Thesis (Selection of subject)Thesis (Selection of subject)(version: 368)
Thesis details
   Login via CAS
Molekulová dynamika excitovaných stavů s neadiabatickými a spinorbitálními efekty akcelerovaná pomocí strojového učení
Thesis title in Czech: Molekulová dynamika excitovaných stavů s neadiabatickými a spinorbitálními efekty akcelerovaná pomocí strojového učení
Thesis title in English: Excited state molecular dynamics with non-adiabatic and spin-orbit effects assisted by machine learning
Academic year of topic announcement: 2024/2025
Thesis type: dissertation
Thesis language:
Department: Department of Chemical Physics and Optics (32-KCHFO)
Supervisor: doc. Dr. rer. nat. Jiří Pittner, DSc.
Author:
Guidelines
Bude upřesněno, podrobnější informace jiri.pittner@jh-inst.cas.cz
References
https://doi.org/10.1021/acs.jctc.2c00804 and references therein

Preliminary scope of work
Molekulová dynamika excitovaných stavů se zahrnutím neadiabatických a spinorbitálních efektů
je důležitým teoretickým nástrojem pro simulaci fotochemických procesů, které hrají důležitou
roli v přírodě a technologii, jako např. fotosyntéza, fototerapie, fotovoltaika aj.
Její výpočetní náročnost při použití ab-inito či DFT metod je ale velmi limitující jak co se týče
velikosti studovaných molekul, tak ohledně délky a počtu počítaných trajektorií. Strojové učení
(ML) získalo v poslední době popularitu díky širokým aplikacím v mnoha oblastech vědy,
průmyslu a komerce. Nedávno se ML metody uplatnily i pro urychlení simulací molekulové
dynamiky v základním stavu a pokroku bylo dosaženo i v ML excitovaných stavů a
neadiabatických efektů. Cílem tohoto projektu je implementovat metody strojového učení pro
molekulovou dynamiku s neadiabatickými a spinorbitálními vazbami a provést ML-akcelerované
MD simulace v excitovaných stavech, kdy dochází k interní konverzi i mezisystémovému
přechodu, s aplikacemi na (modifikované) DNA báze.
Preliminary scope of work in English
Molecular dynamics in excited states including the non-adiabatic and spin-orbit effects is an
important theoretical tool for the simulation of photochemical processes which play an important
role in nature and technology, like e.g. photosynthesis, phototherapy, photovoltaics, etc. Its
computational cost when ab-initio or DFT methods are employed is very limiting in both size of
the molecules treated and the length and number of computed trajectories.
Machine learning (ML) has recently become very popular thanks to its widespread applications
in many areas of science, industry, and commerce. Recently the machine learning methods
have been successfully employed to speed up the molecular dynamics in the ground state, and
some progress was done also on the ML of excited states and non-adiabatic effects. The aim of
this project is to implement
ML methods for MD with nonadibatic and spin-orbit couplings and perform ML-accelerated
molecular dynamics in excited states undergoing both internal conversion and intersystem
crossing processes, with application to (modified) DNA bases.
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html