Strukturní charakterizace interakce dvouvláknových DNA s transkripčním faktorem

• Thesis title in Czech: Strukturní charakterizace interakce dvouvláknových DNA s transkripčním faktorem
• Thesis title in English: Structural characterization of dsDNA and transcription factor interactions
• Key words: dsDNA, transkripční faktor, nativní elektrosprej, pohyblivost iontů, hmotnostní spektrometrie
• English key words: dsDNA, transcription factor, native electrospray, ion mobility, mass spectrometry
• Academic year of topic announcement: 2019/2020
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Biochemistry (31-250)
• Supervisor: RNDr. Petr Novák, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 13.11.2019
• Date of assignment: 19.11.2019
• Date of electronic submission: 10.06.2020
• Date of proceeded defence: 28.07.2020
• Opponents: Mgr. Martin Hubálek, Ph.D.
• Advisors: Mgr. Jan Fiala, Ph.D.

Preliminary scope of work

Příprava proteinů rekombinatní tecnologii v E. coli, určení homogenity proteinové preparátu SDS elektroforesou a hmotnostní spektrometrií, ověření tvorby protein-dsDNA komplexů nativní elektroforesou a nativním elektroprejem, studium struktury protein-dsDNA komplexů měřením jejich efektivního průřezu za různých podmínek

Preliminary scope of work in English

Production of recombinant protein in E. coli, protein homogeneity determination using SDS electrophoresis and mass spectrometry, formation of protein-dsDNA complex validated by native eletrophoresis and native electropray, CCS determitation for protein-dsDNA complexes at different comditions