Vliv genové sekvence na interakci transkripčních faktorů s DNA

• Thesis title in Czech: Vliv genové sekvence na interakci transkripčních faktorů s DNA
• Thesis title in English: Influence of genome sequence on DNA recognition by transcription factors
• Key words: DRE motivy, transkripční faktory, fluorescenční anizotropii, vodík-deuteriová výměna, nativní elektrospray, hmotnostní spektrometrie
• English key words: DNA responce elements, transcription factors, fluorescent anisotrophy, hydrogen-deuterium exchange, native eletrospray, mass spectrometry
• Academic year of topic announcement: 2019/2020
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Biochemistry (31-250)
• Supervisor: RNDr. Petr Novák, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 13.11.2019
• Date of assignment: 13.11.2019
• Advisors: Mgr. Růžena Filandrová, Ph.D.

Preliminary scope of work

Příprava proteinu rekombinatní technologii, elektroforesa za nativních a denaturujících podmínek, určení Kd flurescenční anizotropii, lokalizace vazby DNA na transkripční faktor pomocí H/D výměny, identifikace komplexů nativním elektrosprejem

Preliminary scope of work in English

Recombinant protein production, native and denaturing electrophoresis, Kd determination using fluorescent aniosotrophy, HDX to localize TF DNA binding site, identification of protein - DNA complexes by native electrospray