Exprese V-ATPázy v hypoxii u buněk neuroblastomu

• Thesis title in Czech: Exprese V-ATPázy v hypoxii u buněk neuroblastomu
• Thesis title in English: V-ATPase expression in hypoxic conditions in neuroblastoma cells
• Key words: neuroblastom, chemorezistence, V-ATPáza, hypoxie
• English key words: neuroblastoma, chemoresistance, V-ATPase, hypoxia
• Academic year of topic announcement: 2018/2019
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Biochemistry (31-250)
• Supervisor: prof. MUDr. Tomáš Eckschlager, CSc.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 06.11.2018
• Date of assignment: 07.11.2018
• Date of electronic submission: 18.08.2019
• Date of proceeded defence: 05.09.2019
• Opponents: RNDr. Michaela Čermáková, Ph.D.

Preliminary scope of work

Jedním z popsaných mechanizmů rezistence je „vychytání“ léku v cytoplasmatických
vezikulách (interakce s proteiny), což zabrání jeho působení na cílové struktury v buňce. U
buněk linie odvozené od AML s experimentálně navozenou rezistencí k doxorubicinu bylo
popsáno vychytávání tohoto léku v lysosomech. Dále však nebylo vychytávání léků v
lysosomech příliš studováno. Vychytávání látek v buňkách je zavislé na jejch pK (konstanta
acidity). Bazické látky (vysoká pK) na základě pH gradientu přestupují do kompartmentů
s nízkým pH, kde jsou protonovány. Tento mechanizmus byl popsán u některých léčiv
(lidokain, amidaron). Vakuolární (V)-ATPázy jsou ATP dependentní protonové pumpy a mají
zásadní význam v regulaci pH buněk, buněčných intracelulárních kompartmentů (lysosomy,
endozomy, peroxisomy, Golgiho komplex, sekreční granula) a intercelulárních prostorů. V-
ATPázy udržují realativně neutrální intracelulární pH, kyselé luminální a kyselé
extracelulární. V souvislosti s metabolismem nádorových buněk (metabolismus glukózy,
hypoxie, nedostatečná vaskularizace nádorové tkáně) dochází k výrazné acidifikaci
extracelulárního prostoru a intracelulárních kompartmentů. Bylo prokázáno, že inhibitory V-
ATPáz potencují účinky některých cytostatik.

Cíle: sledovat expresi V-ATPázy a TFEB v hypoxii

Metody: kultivace neuroblastomových linií, izolace RNA, RT-PCR