Cytometric assay of antigen-specific T cell response in monitoring of BCG vaccine therapy
| Thesis title in Czech: | Cytometrický test antigen-specifické T buněčné odpovědi pro monitoring terapií BCG vakcínou |
|---|---|
| Thesis title in English: | Cytometric assay of antigen-specific T cell response in monitoring of BCG vaccine therapy |
| Key words: | T-buněčná odpověď, průtoková cytometrie, aktivační test in vitro, antigenom, imunoterapie nádorů, stratifikace pacientů, personalizovaná medicína |
| English key words: | T-cell response, flow cytometry, in vitro activation test, antigenome, tumor immunotherapy, patient stratification, personalized medicine |
| Academic year of topic announcement: | 2016/2017 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | angličtina |
| Department: | Department of Cell Biology (31-151) |
| Supervisor: | RNDr. Karel Drbal, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval |
| Date of registration: | 25.11.2016 |
| Date of assignment: | 29.11.2016 |
| Date of electronic submission: | 03.01.2019 |
| Date of proceeded defence: | 24.01.2019 |
| Opponents: | prof. MUDr. Tomáš Kalina, Ph.D. |
| Preliminary scope of work |
| Cílem této diplomové práce je detekce nádorově-specifické imunitní odpovědi u pacientů s karcinomem močového měchýře (BCa). Budou použité různé ex vivo aktivační metody průtokové cytometrie. Komplexní fenotyp bude charakterizovaný spolu s antigenní specifitou pacientských T buněk v periferní krvi. V případě odpovídajícího financování budou aplikované dnešní poznatky o mutovaných frekventovaných neoepitopech (tzv. antigenomu) v BCa nádorech pro T-buněčnou odpověď, a tyto budou experimentálně využité pro detailní analýzu. Výsledkem této práce je možnost stratifikace pacientů s BCa na základě jejich popsané imunitní reaktivity. Obecně diskutované budou i dnešní detekční možnosti T-buněčné odpovědi v klinické praxi. |
| Preliminary scope of work in English |
| The goal of this thesis is an experimental detection of tumor-specific immune response in bladder cancer patients (BCa). Multiple ex vivo activation methods of flow cytometry will be used. Complex phenotype background will be characterized together with the antigenic specificity of patient T cells in peripheral blood. Application of our recent knowledge of mutated neoepitopes (so-called antigenome) within the tumor for the T-cell response will be used in detail analysis in case of appropriate budget. The main outcome of this work is an opportunity to stratify BCa patients with respect to described personal immune reactivity. A general discussion on the use of T-cell response detection methods in clinical practice will follow. |