Netradiční funkce forminů mimo nukleaci aktinu

• Thesis title in Czech: Netradiční funkce forminů mimo nukleaci aktinu
• Thesis title in English: Non-traditional roles of formins besides actin nucleation
• Key words: formin, FH2 doména, aktin, cross-talk, profilin, SH3 doména, polyprolinová šroubovice, +konec, cytoskelet, GBD doména, autoinhibice
• English key words: formin, FH2 domain, actin, cross-talk, profilin, SH3 domain, polyproline helix, barbed end, cytoskeleton, GBD domain, auto-inhibition
• Academic year of topic announcement: 2011/2012
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Experimental Plant Biology (31-130)
• Supervisor: prof. RNDr. Fatima Cvrčková, Dr.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 24.11.2011
• Date of assignment: 23.01.2012
• Date of electronic submission: 27.08.2012
• Date of proceeded defence: 17.09.2012
• Opponents: prof. RNDr. Zdeněk Opatrný, CSc.
• Advisors: prof. RNDr. Viktor Žárský, CSc.

Preliminary scope of work

Ačkoli forminy (FH2 proteiny) jsou dávno známé především jako evolučně konzervované nukleítory aktinu, existuje řada starších i novějších dokladů pro jejich účast v dalších procesech, zejména v organizaci mikrotubulárního cytoskeletu a (endo)membránových systémů. Mechanismy těchto "netradičních" interakcí, které již byly doloženy i u rostlin zčásti i přičiněním naší laboratoře (Deeks et al. J. Cell Sci. 123:1209-1215, 2010), se přitom mezi jednotlivými skupinami forminů (a zřejmě i skupinami organismů) značně různí. Cílem práce bude na základě literatury, a popřípadě i bioinformatických postupů, provést "inventuru" popsaných netradičních funkcí forminů a vytipovat potenciální rostlinné homology proteinových domén, které se u jiných skupin organismů "netradičních" funkcí forminů účastní, a které by pak mohly být předmětem experimentálního studia i v navazující práci diplomové.