Charakterizace strukturních parametrů rozhraní mezi Langmuirovou monovrstvou mastných kyselin a povrchem vody na základě molekulových simulací
| Thesis title in Czech: | Charakterizace strukturních parametrů rozhraní mezi Langmuirovou monovrstvou mastných kyselin a povrchem vody na základě molekulových simulací |
|---|---|
| Thesis title in English: | Structural characterization of the interface between a fatty acid Langmuir monolayer and water using molecular simulations |
| Key words: | Langmuirova monovrstva, mastné kyseliny, molekulární dynamika |
| English key words: | Langmuir monolayer, fatty acids, molecular dynamics |
| Academic year of topic announcement: | 2010/2011 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | angličtina |
| Department: | Department of Chemical Physics and Optics (32-KCHFO) |
| Supervisor: | RNDr. Martina Roeselová, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 09.11.2010 |
| Date of assignment: | 09.11.2010 |
| Date and time of defence: | 23.06.2011 00:00 |
| Date of electronic submission: | 26.05.2011 |
| Date of submission of printed version: | 26.05.2011 |
| Date of proceeded defence: | 23.06.2011 |
| Opponents: | RNDr. Ivan Barvík, Ph.D. |
| Guidelines |
| 1. Prostudovat doporučenou literaturu, seznámit se s problematikou Langmuirových monovrstev a se základy relevantních experimentálních technik.
2. Seznámit se se základy molekulové dynamiky a práce s příslušnými programy (GROMACS, VMD). 3. Analyzovat existující data z molekulových simulací Langmuirovy monovrstvy kyseliny palmitové na vodě, vyhodnotit jejich dostatečnost, případně provést další simulace. 4. Z výsledků simulací vyhodnotit parametry charakterizující strukturní vlastnosti jak samotné monovrstvy, tak povrchové vrstvy vody v závislosti na povrchové hustotě organického filmu. 5. Zbyde-li čas, studovat vliv povrchové monovrstvy na translační, příp. rotační dynamiku vody. |
| References |
| 1. Allen, M. P.; Tildesley, D. J.: Computer Simulation of Liquids, Oxford University, New York, 1987
2. Frenkel, D.; Smit, B.: Understanding molecular simulation, From Algorithms to Applications, Academic Press, San Diego, 1990 3. Ulman, A. An Introduction to Ultrathin Organic Films, Academic Press, London, 1991 4. McMullen, R. L.; Kelty, S. P. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 10849-10852 5. Henry, D. J.; Dewan, V. I.; Prime, E. L.; Qiao, G. G.; Solomon, D. H.; Yarovsky, I. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 3869?3878 6. Chanda, J.; Bandyopadhyay, S. J. Chem. Theory Comput. 2005, 1, 963?971 7. Manuály použitých programů |