Počítačové modelování makromolekul
| Thesis title in Czech: | Počítačové modelování makromolekul |
|---|---|
| Thesis title in English: | Computer modelling of Macromolecules |
| Academic year of topic announcement: | 2019/2020 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Physical and Macromolecular Chemistry (31-260) |
| Supervisor: | doc. RNDr. Filip Uhlík, Ph.D. |
| Author: |
| Guidelines |
| Makromolekuly (at jiz polymery nebo biomakromolekuly) a zpusob jak prekonat propast mezi 1fs (cas charakteristicky pro pohyb atomu) a 1ms (cas charakteristicky pro pohyb cele makromolekuly) predstavuji jednu z nejvetsich vyzev pocitacovym simulacim. Naplni navrhovane prace je pokus o podrobnejsi prozkoumani nektere z moznosti, jak tuto propast prekonat. Toto tema je dostatecne siroke pro nekolik studentu od bakalarske po doktorskou praci. Zadne specialni znalosti mimo spolecneho zakladu Bc. nebo MA. studijniho programu chemie ci fyziky nejsou potreba. Konkretni tema je mozne doladit od prosteho vypracovani prace s minimalnim usilim po nejlepsi vedu, ktere je skolitel schopen. Pro vytvoreni konkretniho tematu mne, prosim, nevahejte kontaktovat. Pro inspiraci uvadim nekolik moznosti. 1. Konformacni dynamika molekul DNA, simulace DLS (dynamic light scattering) a FCS (fluorescence correlation spectroscopy) experimentu 2. Monte Carlo simulace slabych polyelektrolytu ve velkem kanonickem souboru 3. Dynamika fluorescencni znacky navazane na makromolekulu |
| Preliminary scope of work |
| Libovolné počítačové simulace makromolekulárního systému dle dohody od zředěného roztoku homopolymeru přes polyelektrolytové komplexy se surfaktanty po dynamiku DNA. |