Isotypové složení aktinu v rostlinné buňce

• Thesis title in Czech: Isotypové složení aktinu v rostlinné buňce
• Thesis title in English: Actin isoforms in the plant cell
• Key words: rostlinný aktin, isotyp aktinu, protein vázající aktin, redundance isotypů
• English key words: plant actin, actin isotype, actin-binding protein, isotype redundancy
• Academic year of topic announcement: 2010/2011
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Experimental Plant Biology (31-130)
• Supervisor: RNDr. Kateřina Schwarzerová, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 08.11.2010
• Date of assignment: 18.01.2011
• Date of electronic submission: 06.05.2011
• Date of proceeded defence: 09.06.2011
• Opponents: Mgr. Jindřiška Fišerová, Ph.D.
• Advisors: RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D.

Preliminary scope of work

Cytoskelet představuje jednu z nejdůležitějších struktur eukaryotické buňky. Tyto proteinové vláknité struktury vznikají polymerací proteinových monomerů tubulinu (v případě mikrotubulů) a aktinu (v případě aktinových filament). Cytoskelet vykonává v živočišných i rostlinných buňkách množství funkcí. Tato mnohočetnost rolí je umožněna dynamikou cytoskeletu i jeho složením. Na funkcích cytoskeletu mají podstatný podíl například asociované proteiny, které regulují dynamiku cytoskeletálních polymerů, interakce mezi cytoskeletálními polymery (svazkování, zesíťování), či jejich interakce s okolními strukturami (organelami, proteinovými komplexy, membránami). Významnou roli ve vlastnostech výsledného cytoskeletálního polymeru však má i složení na úrovni monomerů. Aktiny i tubuliny jsou kódovány genovými rodinami, proto je v buňce syntetizováno vždy několik druhů aktinových a tubulinových monomerů ? izotypů. Jednotlivé monomery jsou navíc dále posttranslačně upravovány, což je zdrojem další heterogenity monomerních podjednotek. V různých částech rostliny je pravděpodobně syntetizována vždy jen určitá skupina izotypů. Například aktiny rostliny Arabidopsis thaliana lze rozdělit do dvou skupin podle toho, zda jsou syntetizovány v generativních či vegetativních pletivech.
?Cílem bakalářské práce je zpracovat formou literárního přehledu současný stav poznání o roli izotypového složení rostlinného aktinového cytoskeletu v životě rostliny. Přehled by měl zahrnout údaje o molekulární podstatě rozdílů mezi izotypy aktinu (rozdíly mezi geny genových rodin, informace o posttranslační modifikaci aktinů), poznatky o jejich expresi v rostlinné buňce, případně o regulaci exprese jednotlivých genů. Dále by měla být pozornost věnována informacím o roli rozdílných izotypů aktinu v různých rostlinných pletivech. Součástí literární rešerše by měl být též základní přehled o metodách, využívaných ke studiu aktinového cytoskeletu a jeho izotypového složení.
?Na bakalářskou práci je možné navázat diplomovou prací ?Role cytoskeletu v průběhu somatické embryogeneze smrku?.