Isoflavonsynthasa: přítomnost a aktivita v bobovitých a nebobovitých rostlinách
| Thesis title in Czech: | Isoflavonsynthasa: přítomnost a aktivita v bobovitých a nebobovitých rostlinách |
|---|---|
| Thesis title in English: | Isoflavone synthase: presence and activity in leguminous and non-leguminous plants |
| Key words: | cytochrom P450, isoflavonsynthasa, CYP93C18, Pisum sativum L., Pachyrhizus tuberozus (Lam.) Spreng, Phaseolus vulgaris L., genová overexprese, GFP, membrána endoplasmatického retikula |
| English key words: | cytochrome P450, isoflavone synthase, CYP93C18, Pisum sativum L., Pachyrhizus tuberozus (Lam.) Spreng, Phaseolus vulgaris L., gene over-expression, GFP, endoplasmic reticulum membrane |
| Academic year of topic announcement: | 2008/2009 |
| Type of assignment: | diploma thesis |
| Thesis language: | angličtina |
| Department: | Department of Experimental Plant Biology (31-130) |
| Supervisor: | prof. RNDr. David Honys, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned by the advisor |
| Date of registration: | 28.11.2008 |
| Date of assignment: | 05.11.2009 |
| Date of electronic submission: | 24.08.2010 |
| Date of submission of printed version: | 24.08.2010 |
| Date of proceeded defence: | 09.09.2010 |
| Reviewers: | doc. RNDr. Radomíra Vaňková, CSc. |
| Preliminary scope of work |
| Isoflavonsynthasa (IFS; člen rodiny CYP93C cytochromů P450), představuje klíčový enzym v biosyntéze isoflavonoidů ? významných sekundárních metabolitů produkovaných především rostlinami z čeledi bobovité (Fabaceae). Geny pro IFS pocházející ze 14 bobovitých rostlin a jedné nebobovité rostliny (Beta vulgaris, čeled´ Chenopodiaceae) byly identifikovány a zařazeny do databáze Genbank. U ostatních taxonů produkujících isoflavonoidy se však o genetickém pozadí této biosyntézy neví takřka nic.
Cílem diplomové práce je nahlédnout problematiku taxonomické distribuce isoflavonoidů z hlediska molekulární genetiky. Práce zahrnuje: 1. in silico analýzu sekvencí genů pro IFS z databáze Genbank a ESTs databáze 2. na PCR metodách (TAIL-PCR, iPCR) založenou identifikaci orthologů genů pro IFS ve vybraných producentských rostlinách náležejících mimo čeled´ bobovitých rostlin 3. funkční testy: over-exprese genů pro IFS získaných z genomů vybraných nebobovitých rostlin v Arabidopsis thaliana (Gateway? technologie) a chemická analýza obsahu isoflavonoidů v transgenních rostlinách (HPLC-MS, ELISA) Poznatky z této práce významnou měrou doplní dosavadní znalosti získané metodami analytické chemie. |