V rámci disertační práce bude studována dynamika modelový proteinů, nukleových kyselin a jejich komplexů v roztoku. K tomu budou využity techniky pulsního značení v kombinaci s hmotnostní spektrometrii. Zaměříme se zejména na využití reaktivních forem kyslíku pro strukturní charakterizaci interakčního rozhraní monoklonálních protilátek a příslušných antigenů nebo nukleových kyselin a jejich proteinových ligandů.
Preliminary scope of work in English
The dynamics of model proteins, nucleic acids and their complexes in solution will be studied as part of the dissertation. For this, pulse labeling techniques in combination with mass spectrometry will be used. We will focus in particular on the use of reactive oxygen species for the structural characterization of the interaction interface between monoclonal antibodies and relevant antigens or nucleic acids and their protein ligands.