hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
Date of registration:
03.10.2023
Date of assignment:
03.10.2023
Confirmed by Study dept. on:
11.10.2023
Advisors:
prof. RNDr. Viktor Žárský, CSc.
Preliminary scope of work
Projekt se zaměří na experimentální charakterizaci biologických funkcí nově identifikovaných protein-proteinových interakcí modelových forminů I. třídy aktivních v modelovém systému vyvíjejícího se kořene Arabidopsis, zejména na forminu AtFH5 a jeho interaktoru SH3P3, jakož i na některé další interagující proteiny identifikované v nedávných proteomických experimentech laboratoře. Budou zkoumány fenotypové účinky mutací se ztrátou funkce nebo zvýšenou expresí forminu nebo interaktorů na celkový vývoj kořenů za normálních podmínek, jakož i v kontextu specifických environmentálních problémů (včetně jednoho konkrétního ošetření abiotickým stresem, u kterého již bylo zjištěno, že vyvolává výraznou fenotypovou reakci atfh5 mutanta). Ve stejných systémech budou použity pokročilé mikroskopické metody ke sledování lokalizace forminů a jejich interaktorů a dynamiky in vivo fluorescenčně značených cytoskeletálních a endomembránových struktur v mutantních rostlinách, aby bylo možné získat vhled do zúčastněných buněčných mechanismů.
Preliminary scope of work in English
The project will focus on experimental characterization of the biological functions of newly identified protein-protein interactions of model class I formins active in the model system of the developing Arabidopsis root, in particular on the formin AtFH5 and its interactor SH3P3, as well as on some additional interacting proteins identified in the lab´s recent proteomic experiments. Phenotypic effects of loss-of-function mutations or overexpression of formin and interactor genes on overall root development in normal conditions, as well as in the context of specific environmental challenges (including one particular abiotic stress treatment already found to elicit a distinctive phenotypic response in atfh5 mutants) will be examined. In the same systems, advanced microscopy methods will be used to follow localization of the formins and their interactors and dynamics of in vivo fluorescently labelled cytoskeletal and endomembrane structures in mutant plants to gain insight into the cellular mechanisms involved.
- assigned and confirmed by the Study Dept.