Strukturní a funkční studie poxvirové RNA polymerázy
| Thesis title in Czech: | Strukturní a funkční studie poxvirové RNA polymerázy |
|---|---|
| Thesis title in English: | Structural-functional investigation of the poxviral RNA polymerase |
| Key words: | RNA polymeráza, purifikace bílkovin, charakterizace bílkovin, poxviry, DNA viry |
| Academic year of topic announcement: | 2023/2024 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Genetics and Microbiology (31-140) |
| Supervisor: | RNDr. Martin Pospíšek, Ph.D. |
| Author: |
| Preliminary scope of work |
| Student/ka se bude podílet na běžícím projektu věnovaném studiu transkripce a translace u poxvirů. Jako model poxvirové RNA polymerázy (RNAP) bude zkoumána polymeráza z kvasinkových virům podobných elementů (VLE Kluyveromyces lactis). Laboratoř má k dispozici špičkové vybavení pro produkci, purifikaci a charakterizaci bílkovin. Student/ka se naučí základní metody přípravy expresních vektorů, heterologní produkci bílkovin v bakteriálním, kvasinkovém a hmyzím buněčném modelu, purifikaci bílkovin po střednětlaké chromatografie a chrakterizaci bílkovin různými biochemickými a fyzikálním technikami včetně analýzy komplexů bílkovin s DNA a RNA pomocí SEC následované multidetektorovou analýzou. Laboratoř je financována s projektů GAČR a velkých rozvojových programů OP JAK a EXCELES financovaných EU. Laboratoř je též součástí nového Národního institutu virologie a bakteriologie (https://nivb.cz/cs/) Odkaz na web laboratoře: https://www.natur.cuni.cz/biologie/genetika/veda-a-vyzkum-1/laborator-biochemie-rna/laborator-biochemie-rna Doporučené publikace k tématu: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2019.02366/full https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1007377 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.07.15.204867v1 |