Studium excitonových interakcí ve světlosběrných komplexech

• Thesis title in Czech: Studium excitonových interakcí ve světlosběrných komplexech
• Thesis title in English: Study of excitonic interactions in light harvesting complexes
• Key words: fykobilizomy|excitonová interakce|2DES|T. elongatus
• English key words: phycobilisomes|exciton|2DES|T. elongatus
• Academic year of topic announcement: 2021/2022
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Chemical Physics and Optics (32-KCHFO)
• Supervisor: Mgr. Jan Alster, Ph.D.
• Author: hidden - assigned and confirmed by the Study Dept.
• Date of registration: 19.10.2021
• Date of assignment: 17.11.2021
• Confirmed by Study dept. on: 21.04.2023
• Date and time of defence: 04.09.2023 09:00
• Date of electronic submission: 19.07.2023
• Date of submission of printed version: 19.07.2023
• Date of proceeded defence: 04.09.2023
• Opponents: Mgr. Jakub Dostál, Ph.D.
• Advisors: doc. RNDr. Jakub Pšenčík, Ph.D.

Guidelines

1. Rešerše literatury zaměřená na vybrané světlosběrné komplexy, u kterých lze předpokládat významný vliv excitonových interakcí na funkci, ale tento předpoklad zatím nebyl ověřen
2. Časově rozlišená spektroskopická měření vybraných světlosběrných komplexů metodou dvoudimenzionální elektronové spektroskopie
3. V případě potřeby rozšíření stávající experimentální aparatury

References

Brixner, T., J. Stenger, H. M. Vaswani, M. Cho, R. E. Blankenship, and G. R. Fleming. 2005. Two-dimensional spectroscopy of electronic couplings in photosynthesis. Nature 434:625-628

Carbonera, D., A. Agostini, M. Di Valentin, C. Gerotto, S. Basso, G. M. Giacometti, and T. Morosinotto. 2014. Photoprotective sites in the violaxanthin-chlorophyll a binding Protein (VCP) from Nannochloropsis gaditana. BBA-Bioenergetics 1837:1235-1246.

Dostal, J., F. Vacha, J. Psencik, and D. Zigmantas. 2014. 2D Electronic Spectroscopy Reveals Excitonic Structure in the Baseplate of a Chlorosome. Journal of Physical Chemistry Letters 5:1743-1747.

Kruger, T. P. J., P. Maly, M. T. A. Alexandre, T. Mancal, C. Buchel, and R. van Grondelle. 2017. How reduced excitonic coupling enhances light harvesting in the main photosynthetic antennae of diatoms. Proc. Natl. Acad. Sci. 114:E11063-E11071.

Reimers, J.R. et al., 2016. Challenges facing an understanding of the nature of low-energy excited states in photosynthesis, Biochim. Biophys. Acta 1857:1627-1640.

Thyrhaug, E., K. Zidek, J. Dostal, D. Bina, and D. Zigmantas. 2016. Exciton Structure and Energy Transfer in the Fenna-Matthews-Olson Complex. Journal of Physical Chemistry Letters 7:1653-1660.

van Amerongen,H., L.Valkunas, and R.van Grondelle. 2000. Photosynthetic excitons. World Scientific, Singapore