Modifikace chromatinu řízené malými RNA
| Thesis title in Czech: | Modifikace chromatinu řízené malými RNA |
|---|---|
| Thesis title in English: | Chromatin modifications directed by small RNAs |
| Key words: | metylace cytosinu, posttranslační modifikace histonů, histonové varianty, epigenetické značení, regulace genové exprese, epigenetika |
| English key words: | cytosine methylation, histone posttranslational modification, histone variants, epigenetic labeling, regulation of gene expression, epigenetics |
| Academic year of topic announcement: | 2024/2025 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | |
| Department: | Department of Experimental Plant Biology (31-130) |
| Supervisor: | RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D. |
| Author: | |
| Advisors: | Mgr. Vojtěch Čermák, Ph.D. |
| Preliminary scope of work |
| Malé RNA jsou klíčovou složkou v procesu RNA interference. V interakci s proteiny Argonaut jsou zodpovědné za rozpoznání komplementárních nukleových kyselin, jejichž aktivita je pomocí malých RNA regulována. Kromě významné role v posttranskripčním umlčování genů (organismu vlastních či např. virových) je zdokumentovaná i role malých RNA v řízení epigenetických změn chromatinu. U rostlin se malé RNA podílejí na cílení de novo metylace DNA a zároveň pomáhají udržovat i stabilně metylované lokusy po proběhlé replikaci DNA. U různých skupin živočichů mohou malé RNA ovlivňovat jak metylaci DNA, tak i přímo modifikace histonů. Náplní bakalářské práce je přinést základní popis funkcí malých RNA a shromáždit dostupné literární údaje o mechanismech, jimiž malé RNA ovlivňují stav chromatinu u různých skupin Eukaryot a proteinech, které se na těchto procesech podílejí. Na bakalářskou práci bude navazovat práce diplomová zaměřená na studium procesu metylace DNA řízené malými RNA. |