Studium strukturně funkčních vztahů elektron-transportních systémů anaerobní respirace P. aeruginosa metodikou PIXL-MS

• Thesis title in Czech: Studium strukturně funkčních vztahů elektron-transportních systémů anaerobní respirace P. aeruginosa metodikou PIXL-MS
• Thesis title in English: Structure-functional study of electron transport anerobic respiration systems of P. aeruginosa via PIXL-MS approach
• Key words: azurin, elektronový přenos, technika fotochemického zesítění (PIXL), hmotnostní spektrometrie, L-azidohomoalanin, foto-Met
• English key words: azurin, electron transfer, photo-induced cross-linking (PIXL), mass spectrometry, L-azidohomoalanin, photo-Met
• Academic year of topic announcement: 2019/2020
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Biochemistry (31-250)
• Supervisor: doc. RNDr. Miroslav Šulc, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 07.11.2019
• Date of assignment: 25.11.2019
• Date of electronic submission: 14.08.2020
• Date of proceeded defence: 16.09.2020
• Opponents: RNDr. Kateřina Bělonožníková, Ph.D.

Guidelines

Biochmie, Org. chemie, Metody biochemie I+II, Moderní metody studia proteinů, Struktura biomolekul

Preliminary scope of work

Práce se zaměřuje na studium proteinu azurinu, který se podílí na elektronovém přenosu v průběhu procesu denitrifikace při anaerobní respiraci některých druhů bakterií (např. P. aeruginosa). Cílem práce bude najít optimální podmínky pro začlenění L-azidohomoalaninu (AHA), strukturního analogu methioninu, do sekvence proteinu, a jeho exprese, purifikace a charakterizace. Finální preparát bude použit pro studium strukturně funkčních vztahů tohoto elektron-transportního systému metodikou PIXL-MS.