Evolution of visual sensory system in the common barbel (Barbus barbus)
Thesis title in Czech: | Evoluce zraku u parmy obecné (Barbus barbus) |
---|---|
Thesis title in English: | Evolution of visual sensory system in the common barbel (Barbus barbus) |
Key words: | smyslové soustavy, zrak, zrakové pigmenty, opsiny, evoluce, ryby, kaprovití, analýza transkriptomu, fluorescenční in situ hybridizace, fylogenetická analýza |
English key words: | sensory systems, vision, retina, visual pigments, opsins, evolution, fish, cyprinids, transcriptome analysis, fluorescent in situ hybridization, phylogenetic analysis |
Academic year of topic announcement: | 2020/2021 |
Thesis type: | diploma thesis |
Thesis language: | angličtina |
Department: | Department of Zoology (31-170) |
Supervisor: | Mgr. Zuzana Musilová, Ph.D. |
Author: | hidden - assigned by the advisor |
Date of registration: | 05.10.2020 |
Date of assignment: | 05.10.2020 |
Date of electronic submission: | 10.08.2022 |
Date of proceeded defence: | 09.09.2022 |
Opponents: | Mgr. Jiří Pergner, Ph.D. |
Preliminary scope of work |
Jak vidí parma? Nevíme. V sítnici má tyčinky i čípky, ty druhé jsou zodpovědné na baerevné vidění během dne. Pak má ale parma obecná jakožto jediná dosud známá sladkovodní ryba čtyři různé geny pro tyčinkový fotoreceptor. A tyčinky slouží k vidění v noci. Všechny ostatní známé druhy ryb mající více než dva tyčinkové geny patří mezi hlubokomořské ryby, kde je zřejmý nedostatek světla. Využívá parma nějakým způsobem své genetické výbavy k lepšímu vidění za nízké intenzity světla? O zraku parmy zatím panuje mnoho nejasností, které lákají k vědeckému prozkoumání. Metody plánované v zadaném tématu: práce s celogenomovými daty a s transkritpomy sítnice. Preparace sítnice, vizualizace jednotlivých fotoreceptorových typů metodou FISH (fluorescent in-situ hybridizace). Barvení jak celých sítnic tak i jejich řezů. Počítání čípků na sítnici. Parmy jsou součástí naší ichtyofauny, pojedeme tedy na ně i do terénu. Nejdůležitějším předpokladem pro tento projekt je motivace, vše ostatní se lze naučit. V případě zájmu se na mě neváhejte obrátit, ráda zodpovím jakékoliv dotazy. |