Interaction of a surface marker of immune cells with low-molecular weight ligands and their polymer conjugates

• Thesis title in Czech: Interakce povrchového markeru imunitních buněk s nízkomolekulárními ligandy a jejich polymerními konjugáty
• Thesis title in English: Interaction of a surface marker of immune cells with low-molecular weight ligands and their polymer conjugates
• Key words: receptor, ligand, rekombinantní protein, polymerní konjugát, HPMA, fluorescence, imunoterapie, CD73, DIANA
• English key words: receptor, ligand, recombinant protein, polymer conjugate, HPMA, fluorescence, immunotherapy, CD73, DIANA
• Academic year of topic announcement: 2017/2018
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: angličtina
• Department: Department of Physical and Macromolecular Chemistry (31-260)
• Supervisor: prof. RNDr. Jan Konvalinka, CSc.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 19.01.2018
• Date of assignment: 19.01.2018
• Date of electronic submission: 03.05.2019
• Date of proceeded defence: 22.05.2019
• Opponents: prof. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D.
• Advisors: RNDr. Pavel Šácha, Ph.D.

Preliminary scope of work

V rámci DP budou připraveny významné receptorové proteiny lidských imunitních buněk pomocí heterologní exprese v savčích buňkách, proteiny budou purifikovány a charakterisovány a budou hledány jejich nízkomolekulární inhibitory (ligandy). Bude vyvíjena aktivitní esej na testování ligandů a u vybraných sloučenin bude provedena biofyzikální charakterisaci jejich interakce s receptorovou molekulou. Vybraný ligand/inhibitor bude dále navázán na polymerní nosič(modifikovaný HPMA polymer) a interakce tohoto konjugátu s cílovou molekulou bude charakterisována. Cílem je připravit specifickou makromolekulu schopnou vazby na cílovou molekulu, její aktivace/inhibice a visualisace pomocí vhodných fluorescenčních značek. Modelovým příkladem vhodného receptoru bude protein CD73, lidská ekto-5´-nucleotidasa, která štěpí extracelulární AMP na adenosin a má v imunitním systému imunosupresivní účinky. Je k disposici rentgenová struktura tohoto receptoru a byly popsány nízkomolekulární inhibitory, které poslouží jako výchozí pár protein/inhibitor pro další studia.