Studium ligandů fosfatas z rodiny haloacidních dehalogenas
Thesis title in Czech:
Studium ligandů fosfatas z rodiny haloacidních dehalogenas
Thesis title in English:
Study of Ligands for Phosphatases from the Haloacid Dehalogenase Superfamily
Key words:
fosfatasy z rodiny HAD, cytosolická purinová 5'-nukleotidasa II, vývoj inhibitorů s využitím malých fragmentů, fosfatasa Tt82, charakterizace katalytické aktivity
English key words:
phosphatases from HAD superfamily, cytosolic purine 5'-nucleotidase II, fragment-based drug discovery, Tt82 phosphatase, characterization of catalytic activity
V rámci projektu budou cíleně vyvíjeny nové účinné látky proti biomedicínsky významnému lidskému enzymu cytosolická purinová 5'-nukleotidasa II, který byl identifikován jako cíl pro léčbu nemocí způsobených patogenními mikroorganismy nebo spojených s rozvojem nádorových onemocnění. K vývoji látek budou využity metody vycházející z malých fragmentů. Práce na projektu je vynikající příležitostí získat odborné znalosti a praktické zkušenosti v proteinové biochemii, biofyzice a strukturní biologii, a také přehled o přístupech k racionálnímu vývoji léčiv prostřednictvím úzké spolupráce s výzkumnými týmy, které se zabývají medicinální a výpočetní chemií.
Preliminary scope of work in English
The project will be focused on the knowledge-based design of active compounds targeting biomedicinally relevant human enzyme called cytosolic purine 5'-nucleotidase II, which is implicated in the diseases caused by pathogenic microorganisms or linked to the development of malignancies. The compounds will be developed using the fragment-based approach. The work on this project provides the opportunity to acquire an expertise in protein biochemistry, biophysics and structural biology, as well as to get an insight into the rational drug design process through a close collaboration with the medicinal and computational chemistry research teams.
- assigned by the advisor