Využití metod masivně paralelního sekvenování ve studiu ekologie arbuskulárně mykorhizních hub
| Thesis title in Czech: | Využití metod masivně paralelního sekvenování ve studiu ekologie arbuskulárně mykorhizních hub |
|---|---|
| Thesis title in English: | Aplication of high-throughput sequencing methods in arbuscular mycorrhizal fungal ecology |
| Academic year of topic announcement: | 2017/2018 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Experimental Plant Biology (31-130) |
| Supervisor: | Mgr. Petr Kohout, Ph.D. |
| Author: | |
| Advisors: | RNDr. Zuzana Kolaříková, Ph.D. |
| Preliminary scope of work |
| Arbuskulárně mykorhizní houby vytváří jednu z nejrozšířenějších mutualistických symbióz mezi rostlinami a vláknitými půdními houbami. Za zvýšení přijmu minerálních živin a vody a ochranu proti patogenům, dodává rostlina arbuskulárně mykorhizním houbám nezbytné uhlíkaté látky, které mykorhizním houbám slouží, jako zdroj energie. Na rozdíl od obrovské diverzity arbuskulárně mykorhizních rostlin (přibližně 180tis. druhů), arbuskulární mykorhizu tvoří pouze cca 250 známých druhů hub, které všechny patří do oddělení Glomeromycota. Nástup nových metod masivně paralelního sekvenování (MMPS) DNA umožnil detailnější studium ekologie těchto ekologicky významných hub. Použití MPS studium ekologie arbuskulárně mykorhizních však sebou Cílem bakalářské bude literární rešerše současných znalostí o využití MMPS v ekologii arbuskulárně mykorhizních hub. Bakalářská práce se bude především zaměřovat na kritické zhodnocení využití těchto moderních metod a identifikaci jejich případných nedostatků. Na bakalářskou práci lze navázat i téma práce diplomové. Diplomová práce nabízí osvojení moderních metod molekulární biologie (Illumina MiSeq a PacBio sekvenování), bioinformatiky a statistiky a práci ve velkém vědeckém kolektivu. Zadané téma je součástí řešených vědeckých projektů (GAČR). |