Mechanismy translační represe zprostředkované miRNA

• Thesis title in Czech: Mechanismy translační represe zprostředkované miRNA
• Thesis title in English: miRNA-mediated translational repression
• Key words: miRNA; translační represe; deadenylace mRNA; degradace mRNA; GW182; PAN2-PAN3; CCR4-NOT; 4E-T; eIF4E2; GIGYF2
• English key words: miRNA; translational repression; mRNA deadenylation; mRNA decay; GW182; PAN2-PAN3; CCR4-NOT; 4E-T; eIF4E2; GIGYF2
• Academic year of topic announcement: 2017/2018
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
• Supervisor: RNDr. Tomáš Mašek, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 30.11.2017
• Date of assignment: 30.11.2017
• Date of electronic submission: 07.05.2019
• Date of proceeded defence: 03.06.2019
• Opponents: RNDr. Petra Fryaufová, Ph.D.

Preliminary scope of work

Mnoho pokusů v posledních letech pomohlo vytvořit ucelený obrázek o tom, jak funguje deadenylace a degradace cílových transkriptů zprostředkovaná miRNA. Naproti tomu, se dosud nepodařilo odhalit mechanizmus translační represe, a to i přesto, že tento fenomén byl zjištěn v několika celogenomových studiích. V současnosti byly navrženy tyto mechanizmy účinku, (i) GW182-zprosředkované odstranění PABP z polyA ocásků v iniciačních komplexech, (ii) navázaní translačních inhibitorů pomocí GW182 a (iii) odstranění helikázy eIF4A z iniciačních komplexů. Je samozřejmé, že tyto mechanizmy se navzájem nevylučují, mohou se do značné míry překrývat a doplňovat.
Nabízená bakalářská práce je zaměřena na vypracování souhrnného článku, který by měl nabídnout aktuální informace o miRNA zprostředkované translační represi se zvláštním zřetelem na molekulární podstatu tohoto děje.

Preliminary scope of work in English

In recent years, many experiments have provided a detailed picture of the mechanism of miRNA-mediated mRNA decay. By contrast, it still remains unclear how animal miRNAs repress translation of target mRNAs. Translational repression at the initiation step is supported by recent genome-wide analyses of endogenous miRNA targets. Three major mechanisms have been proposed, including (i) GW182-mediated PABP displacement, (ii) recruitment of the translational repressors through GW182, and (iii) dissociation of eIF4A from the cap-binding complex eIF4F. These mechanisms might not be mutually exclusive; they may overlap.
The proposed bachelor thesis is focused on the summarization of recent data about miRNA-induced translation repression with a great emphasis on underlying molecular mechanisms.