Regulatory mechanisms of CD47 surface expression

• Thesis title in Czech: Mechanismy regulace povrchové exprese CD47
• Thesis title in English: Regulatory mechanisms of CD47 surface expression
• Key words: CD47, transkripční program, transkripční faktor, responzivní element, epigenetická regulace, promotor
• English key words: CD47, transcription program, transcription factor, responsive element, epigenetic regulation, promoter
• Academic year of topic announcement: 2016/2017
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: angličtina
• Department: Department of Cell Biology (31-151)
• Supervisor: RNDr. Karel Drbal, Ph.D.
• Author: Mgr. Martin Jakubec - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval
• Date of registration: 24.11.2016
• Date of assignment: 29.11.2016
• Date of electronic submission: 14.05.2017
• Date of proceeded defence: 06.06.2017
• Opponents: RNDr. Michal Dibus, Ph.D.

Preliminary scope of work

Cílem této bakalářské prace je poznání regulačních procesů, které vedou ke zvýšené nebo snížené expresi homeostatického znaku na povrchu všech lidských buněk - molekuly CD47. Jedná se o přímou regulaci transkripce CD47 transkripčními a epigenetickými mechanismy na úrovni DNA, stabilitu RNA, ale také o nepřímou regulaci exprese proteinu CD47 na povrchu buňky regulací jeho transportu a "turnoveru". Význam této regulace je patrný z použití inhibitorů jeho interakce s molekulou SIRPa na makrofázích, a to již v několika klinických testech nádorových onemocnění.
Autor bude ve své práci používat bioinformatické nástroje a publikovaná data. Základní informační kanály jsou:
Klíčové zdroje:
http://www.nature.com/stemcells/2009/0908/090827/full/stemcells.2009.116.html

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20452821

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23722425

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15985538

Trials:
https://clinicaltrials.gov/
http://stemcell.stanford.edu/CD47/
http://trilliumtherapeutics.com/