Radikálové značení proteinů jako nástroj validace biologických terapeutik

• Thesis title in Czech: Radikálové značení proteinů jako nástroj validace biologických terapeutik
• Thesis title in English: Protein radical footprinting as a tool for protein therapeutcs validation.
• Key words: Proteiny, radikálové značení, Togniho činidlo, hmotnostní spektrometrie, proteinová terapeutika
• English key words: Proteins, radical footprinting, Togni reagents, mass spectrometry, protein drugs
• Academic year of topic announcement: 2016/2017
• Thesis type: Bachelor's thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Biochemistry (31-250)
• Supervisor: RNDr. Petr Novák, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 09.11.2016
• Date of assignment: 09.11.2016
• Date of electronic submission: 25.05.2018
• Date of proceeded defence: 12.06.2018
• Opponents: RNDr. Tomáš Ječmen, Ph.D.
• Advisors: Mgr. Zdeněk Kukačka, Ph.D.

Preliminary scope of work

Úkolem uchazeče bude optimalizace reakce proteinů s Togniho činidlem, které ma schopnost radikálovým mechanismem vnést halogen-alkyl do molekuly proteinu. Chemicky modifikované proteiny budou analyzovány hmotnostně spektrometrickými metodami, aby se přesně lokalizovaly modifikované postranní řetězce aminokyselin. Popsaným postupem bude následně studována interakce mezi monoklonální protilátkou, která se používá u biologických terapii nádorových onemocnění, a příslušným antigenem.