3D zobrazovací metody myšího mozku se zaměřením na projasnění tkáně
| Thesis title in Czech: | 3D zobrazovací metody myšího mozku se zaměřením na projasnění tkáně |
|---|---|
| Thesis title in English: | Methods of murine brain 3D imaging focusing on tissue clearing |
| Key words: | 3D modely mozku, zobrazování neuronů a imunitních buněk, techniky projasnění vzorku, mikroskopické techniky, konfokální, "lightsheet", "spinning"-disk, MRI, EM |
| English key words: | 3D brain models, neuron/immune cell imaging, sample clearing techniques, microscopy techniques, confocal, lightsheet, spinning-disc, MRI, EM |
| Academic year of topic announcement: | 2016/2017 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Cell Biology (31-151) |
| Supervisor: | RNDr. Karel Drbal, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval |
| Date of registration: | 26.10.2016 |
| Date of assignment: | 29.11.2016 |
| Date of electronic submission: | 15.05.2017 |
| Date of proceeded defence: | 02.06.2017 |
| Opponents: | doc. Mgr. Pavel Němec, Ph.D. |
| Preliminary scope of work |
| Metody projasnění ("clearing") tkání jsou moderním přístupem ke 3D zobrazení velkoobjemových vzorků. Primárním účelem této bakalářské práce je metodický popis a srovnání používaných technik projasnění vzorků. V kombinaci s moderními přístupy optických řezů více technikami světelné mikroskopie pak slouží k vizualizaci komplexních struktur tkání a celých orgánů. Na příkladu myšího mozku o rozměrech kolem 400 mm^3 budou různé alternativy snímání detailních struktur takto velkých vzorků kriticky zhodnocené, a to včetně porovnání s dalšími technikami MRI, EM a světelné mikroskopie. Odkazy na databáze a atlasy 3D modelů myšího mozku budou součástí této bakalářské práce. Při velkém počtu citací lze práci zacílit na otázku existence propojení CNS s imunitním systémem, respektive krevní a lymfatickou vaskulaturou ("blood-brain barrier"). Naopak je možné při nedostatku citací zpracovat informace o myší lymfatické uzlině, která je sice objemově menší, ale obsahuje veké množství pojivové tkáně, která činí projasnění složitějším. Oblast zpracování dat a jejich vizualizace mohou být součástí práce. Doporučená literatura: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15342433 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26245559 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26876372 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24792442 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26368944 |