Metodiky detekce antigen-specifických T buněk ex vivo
| Thesis title in Czech: | Metodiky detekce antigen-specifických T buněk ex vivo |
|---|---|
| Thesis title in English: | Antigen-specific T cell ex vivo detection methods |
| Key words: | T buňka, buněčná imunitní odpověď, antigenní peptid, struktura TCR, pMHC tetramer, frekvence naivních prekursorů T buněk v periferní krvi, nepřímá aktivace T buněk |
| English key words: | T cell, cellular immune response, antigenic peptide, TCR structure, pMHC tetramer, naive T cell precursor frequency in peripheral blood, T cell bystander activation |
| Academic year of topic announcement: | 2015/2016 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Cell Biology (31-151) |
| Supervisor: | RNDr. Karel Drbal, Ph.D. |
| Author: | hidden - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval |
| Date of registration: | 18.11.2015 |
| Date of assignment: | 25.11.2015 |
| Date of electronic submission: | 17.08.2016 |
| Date of proceeded defence: | 09.09.2016 |
| Opponents: | doc. RNDr. Magdaléna Krulová, Ph.D. |
| Preliminary scope of work |
| Detekce Ag-specifických T buněk je klíčovou metodikou moderní diagnostiky imunologicky relevantních lidských patologií. Jedná se o infekční choroby, autoimunitní onemocnění i nádory. Cílem této bakalářské práce je analýza moderních přístupů na různých úrovních testování frekvence Ag-specifických T buněk a jejich subpopulací. Přehled musí obsahovat i komerční kity a patenty, které jsou v klinice dnes používané. Autor si může vybrat konkrétní typ onemocnění a zdůvodnit proč je některá z používaných metodik vhodnější než jiná. Parametry jsou: rychlost, přesnost, prediktivní hodnota a nakonec i standardní hodnoty každého diagnostického testu: specifita, selektivita, senzitivita.
Ag-specifita může být testovaná více způsoby na základě přímé i nepřímé detekce (různé typy aktivačních testů). Autor se zaměří více na přímou detekci a podá možný výhled do budoucna. Bioinformatické možnosti zpracování genomických informací vhledem k mechanismu MHC restrikce musí být diskutované. Základní citace: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23788442 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24715893 2002 issue of J Immunol Methods: http://www.sciencedirect.com/science/journal/00221759/268/1 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24441473 |