Preparation and characterization of functionalized surfaces for desorption-ionization mass spectrometry

• Thesis title in Czech: Příprava a charakterizace funkcionalizovaných povrchů pro desorpční hmotnostní spektrometrii
• Thesis title in English: Preparation and characterization of functionalized surfaces for desorption-ionization mass spectrometry
• Key words: Reaktivní depozice, funkcionalizované povrchy, hmotnostní spektrometrie, proteasy, glykosidasy, strukturní proteomika
• English key words: Reactive ion landing, functionalized surfaces, mass spectrometry, proteases, glycosidases, structural proteomics
• Academic year of topic announcement: 2015/2016
• Thesis type: dissertation
• Thesis language: angličtina
• Department: Department of Biochemistry (31-250)
• Supervisor: RNDr. Petr Novák, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 21.10.2015
• Date of assignment: 21.10.2015

Preliminary scope of work

Příprava a optimalizace produkce vybraných proteas, optimalizace depozice proteas a glykosidas na vodivé povrchy. Charakterizace a studium aktivity proteolyticky a glykolyticky aktivních povrchů, vývoj MS metod a algoritmů pro interpretaci MS dat. Testování využitelnosti proteolyticky aktivních povrchů pro limitovanou proteolysu, chemické zesítění a vodík/deuteriovou výměnu.

Preliminary scope of work in English

Preparation and optimalization of proteases production, ortimalization of reactive ion landing deposition on conductiove surfaces. Characterization and activity studies of proteolytic and glycolytic surfaces, MS methods design and MS data interpretation algorithm development. Utilization of proteolytically active surfaces for limited proteolysis, chemical cross-linking and H/D exchange.