Antigenome defines a selection of mutated tumor peptides driving tumor-specific T-cell response
| Thesis title in Czech: | Antigenom definuje výběr mutovaných peptidů pro nádorově-specifickou T-buněčnou imunitní odpověď |
|---|---|
| Thesis title in English: | Antigenome defines a selection of mutated tumor peptides driving tumor-specific T-cell response |
| Key words: | antigenom, T-buněčná odpověď, somatická mutace, MHC-restrikce, nádorový biomarker, imunoterapie nádorů, stratifikace pacientů, personalizovaná medicína |
| English key words: | antigenome, T-cell response, somatic mutation, MHC-restriction, tumor biomarker, tumor immunotherapy, patient stratification, personalized medicine |
| Academic year of topic announcement: | 2014/2015 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | angličtina |
| Department: | Department of Cell Biology (31-151) |
| Supervisor: | RNDr. Karel Drbal, Ph.D. |
| Author: | Mgr. Petra Hadlová - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval |
| Date of registration: | 13.11.2015 |
| Date of assignment: | 13.11.2015 |
| Date of electronic submission: | 18.08.2016 |
| Date of proceeded defence: | 08.09.2016 |
| Opponents: | RNDr. Michal Dibus, Ph.D. |
| Preliminary scope of work |
| Cílem této bakalářské práce je popis nádorového antigenomu, který je definován jako ta část genomové sekvence, která po překladu a přepisu do proteinových lineárních motivů a složitějších struktur slouží jako cíle imunitní odpovědi. Naprostá většina dosud publikovaných prací takového systémového přístupu cílí protilátkovou odpověď v séru pacientů se specifickými chorobami, nejčastěji infekčními. Úkolem je: 1/ zmapování konkrétních výsledků serologického metodického přístupu a 2/následně se zaměřit na jeho aplikaci pro T-buněčnou odpověď, konkrétně pro využití v diagnostice nádorových (případně i infekčních) onemocnění. Dynamika cílových sekvencí/struktur v čase a selekce jejich podmnožiny, která je rozpoznaná imunitním systémem je klíčem k úspěšné identifikaci stratifikaci pacientů. Diskutovány budou dnešní detekční možnosti T-buněčné odpovědi v klinice. Klíčové zdroje: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23258224 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25409260 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24790791 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25164877 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24829748 Příklad infekčního onemocnění (TB): http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25009541 Metody: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24441473 |