Variabilita ve složení gastrointestiní mikrobioty napříč trávicím traktem u obratlovců
| Thesis title in Czech: | Variabilita ve složení gastrointestiní mikrobioty napříč trávicím traktem u obratlovců |
|---|---|
| Thesis title in English: | |
| Academic year of topic announcement: | 2014/2015 |
| Thesis type: | Bachelor's thesis |
| Thesis language: | čeština |
| Department: | Department of Zoology (31-170) |
| Supervisor: | Mgr. Jakub Kreisinger, Ph.D. |
| Author: |
| Preliminary scope of work |
| Trávicí trakt obratlovců je kolonizován taxonomicky a početně velmi bohatou komunitou komenzálních a symbiotických bakterií. Celkový počet bakteriálních buněk více než řádově přesahuje počet somatických buněk v těle hostitele a ještě větší disproporce jsou mezi počtem genů kódovaných tímto bakteriálním metagenomem a genomem hostitele. Gatrointestinální mikrobiota (GM) ovlivňuje zásadním způsobem fyziologii hostitele a imunitu hostitele. Konkrétně se podílí na obraně proti gastrointestinálních patogenů, zvyšuje efektivitu trávení přijímané potravy, má přímý vliv na morfologii trávicího traktu fungování centrálního nervového systému a vývoj kognitivních vlastností. Většina současných studií na toto téma sleduje vliv GM na fenotypové vlastnosti hostitele pouze na základě analýz vzorků GM z distálních částí tlustého střeva. Avšak GM vykazuje značnou variabilitu ve složení napříč trávicím traktem a není proto jasné, do jaké míry GM v jednotlivých částech trávicího traktu ovlivňuje fenotyp hostitele. Úkolem studenta vypracovat na základě dostupné literatury komparativí studii, která by posoudila variabilitu GM napříč trávicím traktem a jejjí vliv na fenotypové vlastnosti hostitele u obratlovců. Preferujme studenty, kteří by měli zájem v tomto tématu pokračovat i během magisterského studia a ideálně se podílet na laboratorních pracích již během řešení bakalářského projektu (viz téma diplomové práce: “Variabilita ve složení gastrointestiní mikrobioty napříč trávicím traktem ptáků„). Literatura Stearns, J. C., Lynch, M. D., Senadheera, D. B., Tenenbaum, H. C., Goldberg, M. B., Cvitkovitch, D. G., ... & Neufeld, J. D. (2011). Bacterial biogeography of the human digestive tract. Scientific reports, 1. Keenan, S. W., Engel, A. S., & Elsey, R. M. (2013). The alligator gut microbiome and implications for archosaur symbioses. Scientific reports, 3. Faust, K., Sathirapongsasuti, J. F., Izard, J., Segata, N., Gevers, D., Raes, J., & Huttenhower, C. (2012). Microbial co-occurrence relationships in the human microbiome. PLoS computational biology, 8(7), e1002606. |